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遵义医科大学马虎教授团队在JITC发布肿瘤免疫环状 RNA 数据库

01月12日
整理:肿瘤资讯
来源:肿瘤资讯

近十年,以免疫检查点为靶点的免疫疗法(Immune Checkpoint blockades, ICBs) 在癌症治疗中越来越受到关注,但其泛瘤种有效率仅 20%左右,如何有效筛选潜在获益人群是肿瘤免疫研究和临床诊治的热点和难点。研究表明,环状RNA(circRNA)是肿瘤免疫的关键调控因子,在黑色素瘤等瘤种中展现出作为免疫治疗分子标志物的潜能。然而,人们对circRNA在肿瘤免疫治疗中的作用尚未完全了解。现有的数据资源库要么倾向于疾病和多物种circRNA图谱的解析,要么倾向于肿瘤免疫治疗队列的基因表达研究,还没有能够探索circRNA与肿瘤免疫治疗响应与预后关联的高质量数据研究平台。

基于此,遵义医科大学第二附属医院马虎教授团队近日以遵义医科大学为第一完成单位在国际著名肿瘤免疫学期刊Journal for Immunotherapy of Cancer(JITC)(IF2022:10.09, 癌症免疫治疗学会会刊)上发表题为“TCCIA: A Comprehensive Resource for Exploring CircRNA in Cancer Immunotherapy“的研究成果。研究团队搜集并整合了25个肿瘤免疫治疗临床队列的超过4000例肿瘤样本,然后进行统一的RNA-seq测序原始数据和临床表型数据预处理、circRNA检测、免疫细胞组分解析、肿瘤分子特征评分等,以此构建出首个综合性的肿瘤免疫治疗circRNA数据库TCCIA(The Cancer CircRNA Immunome Atlas),为探索circRNA与肿瘤免疫治疗疗效和肿瘤/免疫分子特征的关联和互作、挖掘和验证circRNA分子标志物提供了重要的数据资源和分析平台。

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TCCIA图形摘要

遵义医科大学第二附属医院客座研究员、中山大学肿瘤防治中心博士后王诗翔为本论文第一作者,中南大学湘雅医院博士生熊逸与张益浩为共同第一作者,胸部肿瘤科周建国副主任医师(学校未来“科技菁英”计划入选者)为本论文通讯作者,马虎副院长、中山大学肿瘤防治中心赵齐副研究员以及中南大学湘雅医学院李学军副院长为共同通讯作者。美国国立癌症研究所王海涛研究员、德国纽伦堡-埃尔朗根大学Udo Gaipl教授、南方医科大学珠江医院罗鹏老师、上海交通大学瑞金医院助理研究员李剑峰等对本项目研究提供了指导和支持。该项研究得到了国家自然科学基金、博士后面上基金、贵州省科技厅、教育厅及卫健委、遵义市及学校等相关项目的资助。

TCCIA数据库链接:https://shiny.hiplot.cn/TCCIA/ 
(备选网址
http://tccia.zmu-zhoulab.com/http://shiny.zhoulab.ac.cn/TCCIA

原文链接: http://dx.doi.org/10.1136/jitc-2023-008040




责任编辑:肿瘤资讯-小编
排版编辑:肿瘤资讯-小编



评论
01月14日
梁留峰
叶县人民医院 | 消化内科
了解环状RNA(circRNA)是肿瘤免疫的关键调控因子
01月14日
宋忠全
潍坊市人民医院 | 内科
受益匪浅,继续努力
01月13日
吴耀禄
延安大学附属医院 | 普通外科
环状RNA(circRNA)是肿瘤免疫的关键调控因子,在黑色素瘤等瘤种中展现出作为免疫治疗分子标志物的潜能