首页 > 文章详情

【2021 ASCO 抢先看】250例难治性或复发性（R/R）儿童实体肿瘤的整合全外显子组和转录组分析

2021年05月25日

来源：肿瘤资讯

美国临床肿瘤学会（ASCO）年会将于2021年6月4日至8日开展。近日，ASCO官网公布了肿瘤学各领域最新进展及相关研究摘要，多项儿童肿瘤相关研究也公布了试验结果，并将在大会上作出口头报告。由戴尔公司资助、美国国立卫生研究院牵头开展的研究（注册号：NCT01355679， NCT01802567， NCT02162732），对难治性或复发性儿童实体肿瘤的整合全外显子组和转录组进行了分析，对于未来儿科肿瘤的精准诊疗或有指导意义。

微信图片_202105210947511.jpg

研究背景

既往研究中，主要基因组图谱研究已经协助确定了儿童肿瘤的分子景观，目前这些基因组特征通常仅被用于未经治疗的儿童肿瘤诊断。尽管随着诊疗水平的进步，儿童肿瘤患者的总生存率有所提高，但顽固性或复发性（R/R）实体肿瘤的儿童患者预后仍然较差。目前，R/R疾病的基因组基础特征不太明确，亟待解决。这项研究描述了几项精准医学研究（NCT01355679， NCT01802567， NCT02162732）中，来自202名儿童的250例R/R实体肿瘤的整合基因组和转录组分析，以期为R/R患儿后续的临床研究及诊疗提供参考。

研究方法

肿瘤-正常全外显子和肿瘤mRNA测序由Ashion分析公司承担进行，总共对20例患者的纵向肿瘤样本进行了测序。发现的基因组改变包括：单核苷酸变异、缺失突变、拷贝数改变和基因融合。整合基因组学和转录组学研究分析包括微卫星不稳定性评估、免疫基因组谱分析和功能基因富集分析。

研究结果

测序共发现46种肿瘤类型，总体分为4大类，包括：肉瘤（36.1%；n = 73），神经母细胞瘤（29.2%；n = 59），中枢神经系统肿瘤（23.3%；n = 47），其他罕见肿瘤（11.4%；n = 23）。

对于具有全外显子组测序数据的患者，78.3% （n=144/184）的肿瘤存在至少一个已知癌基因的改变；超过三分之一（39.1%；72/184）的患者存在一个已知癌基因的致癌融合和/或致癌/可能致癌的热点突变；25%（46/184）的肿瘤有症状性融合，且最常发生在肉瘤中；8.7%（16/184）的患者中发现了致病性或可能致病性种系变异。

在5种不同的肿瘤类型中检测到微卫星不稳定性。尽管几乎所有的肿瘤（94%，173/184）都具有至少一种预测性强结合抗原，超过四分之一的肿瘤缺乏这些新抗原的转录表达，抑或是MHC I分子表现为低表达。此外，一组肿瘤显示出共抑制免疫检查点分子PD-L1表达上调。

转录分析和功能基因集合富集分析确定了与免疫信号通路、发育信号和细胞信号传导通路相关的交叉病理肿瘤集群。纵向分析显示了时间异质性，指示复发时重新活检对靶向治疗计划的重要性。

研究结论

综上所述，这些数据表明R/R儿童实体肿瘤具有共同的分子特征，这些特征反映了潜在的生物学特征，说明了综合分析对R/R疾病的分子引导治疗的重要性。

参考文献

Sara A. Byron， William P. D. Hendricks， Abhinav B. Nagulapally， Karl Dykema， Jeffrey Bond， Hsien-Chao Chou， Jun S. Wei， Xinyu Wen， Hue V. Reardon， Sara Nasser， Tyler Izatt， Daniel Enriquez et al. Integrated whole-exome and transcriptome analysis of 250 treatment-refractory or relapsed （R/R） childhood solid tumors. ASCO PEDIATRIC ONCOLOGY 10006

责任编辑：Amy
排版编辑：Amy