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2023 SABCS｜染色体不稳定驱动的乳腺癌进化、免疫逃避和转移

2023年12月11日

编译：肿瘤资讯

来源：肿瘤资讯

由 UT Health San Antonio 梅斯癌症中心和 AACR 共同主办的年度活动--2023年圣安东尼奥乳腺癌研讨会 (SABCS)年会已于2023年12月5-9日在美国德克萨斯州圣安东尼奥举行。今年是该会议举办的第 46 个年头，吸引了来自世界各地的约 10,000 名临床医生和科学家，是乳腺癌研究领域规模最大、最负盛名的科学聚会。2023年12月7日上午，美国萨斯州西南医学中心，西蒙斯综合癌症中心Carlos Arteaga医学博士主持了“全体会议：染色体不稳定驱动的乳腺癌进化、免疫逃避和转移”，英国伦敦弗朗西斯·克里克研究所Charles Swanton医学博士就此主题进行了详细的汇报。【肿瘤资讯】特此整理了相关内容，与读者分享。

摘要号：PL-01

讲者：Charles Swanton

中文标题：染色体不稳定驱动的乳腺癌进化、免疫逃避和转移

原标题：Breast Cancer Evolution, Immune Evasion and Metastasis Driven by Chromosomal Instability

染色体不稳定性（CIN）是一种预后不良的特征，在乳腺癌中发病率很高，并且是导致乳腺癌进化过程中亚克隆内体细胞拷贝数畸变和肿瘤内异质性（ITH）的原因。我们观察到 SCNA 在转移样本中富集，包括 HER2 +中染色体 11q13.3（包含 CCND1）的增加乳腺癌。然而，迄今为止，还没有对乳腺癌瘤内异质性进行前瞻性、全面的研究。

我们将展示来自 TRACERx Breast/SCANDARE 的数据，这是一项针对三阴性乳腺癌 (TNBC) 的前瞻性、多中心研究，其中在新辅助治疗之前以及包括手术和复发在内的纵向时间点从原发性 TNBC 收集了多区域活检。我们发现治疗前原发肿瘤中体细胞突变和 SCNA 存在普遍的肿瘤内异质性。我们利用该队列中丰富的临床注释将肿瘤内异质性评分与关键临床结果相关联，包括治疗反应（对新辅助化疗的病理完全反应）和生存。我们发现 CIN 表现为染色体外 DNA (ecDNA) 的致癌扩增，在驱动耐药性和肿瘤进化中发挥着关键作用。

通过对来自 Genomics England 乳腺癌队列的 2936 个乳腺肿瘤的全基因组测序数据进行分析，我们在 46.4% 的 HER2+ 乳腺癌中发现了由 ecDNA 驱动的局灶性扩增。EcDNA 在转移性肿瘤中富集，并与不良的临床结果相关。除了癌症进化过程中源自 ecDNA 的 HER2 等致癌扩增之外，ecDNA 还包含与 T 细胞浸润减少相关的免疫调节基因。CIN 的进一步免疫调节是 HLA 基因座 (HLA LOH) 杂合性丧失的结果，是乳腺癌中常见的亚克隆事件。CIN进一步驱动单倍体LOH，导致TNBC中全基因组加倍和进一步CIN的高发生率。肿瘤是不同克隆的异质组合物，具有不同的 SCNA 互补性和不同的适应水平，因此测量单个克隆的增殖以预测未来的进化结果可能至关重要。

我们开发了 SPRINTER（通过进化途径推断非均质肿瘤的单细胞增殖率），这是一种利用单细胞全基因组 DNA 测序数据测量单个肿瘤克隆增殖率的新型计算方法。我们将 SPRINTER 应用于 42,009 个三阴性乳腺癌细胞，证明不同肿瘤克隆之间存在显着的增殖异质性。重要的是，我们显示了较高的增殖率和体细胞变异率增加之间的相关性，表明增殖与克隆进化性有关。

总而言之，这些补充分析为 CIN 在驱动 ITH、选择、转移和免疫逃避中的重要性提供了证据，并提供了确定乳腺癌进化中反复出现的进化模式的框架。

参考文献

Charles Swanton. Breast Cancer Evolution, Immune Evasion and Metastasis Driven by Chromosomal Instability. 2023 SABCS Abstract FL-01.

责任编辑：肿瘤资讯-Annie
排版编辑：肿瘤资讯-张薪媛