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快讯｜NIH公布了全面的蛋白质基因组数据集，帮助癌症研究人员解开分子奥秘

2023年08月18日

整理：肿瘤资讯

来源：肿瘤资讯

8月14日，美国国立卫生研究院（NIH）官网发布了一则新闻，宣布将公布全面的蛋白质基因组数据集，旨在帮助癌症研究人员揭开分子之谜，加速癌症研究的进展。

美国国立卫生研究院（National Institutes of Health）公布了这个全面的数据集，对来自10种癌症类型的1,000多种肿瘤的个体研究数据进行了标准化处理，包括基因组、蛋白质组学、影像学和临床数据。全球研究人员可以利用这一公共资源来发现癌症发生、发展并形成新的见解/认知。该数据集是由美国国立卫生研究院下属的美国国家癌症研究所的临床蛋白质组肿瘤分析联盟（CPTAC）创建的。

一篇发表在《癌细胞》（Cancer Cell）上的论文（Proteogenomic data and resources for pan-cancer analysis）对这个泛癌症蛋白质基因组数据集进行了描述^[1]。该数据集建立在蛋白质组学技术多年来的进步基础之上，将有助于加速癌症研究。CPTAC的研究人员在《细胞》（Cell）杂志上发表的另外两篇研究论文^[2-3]初步展示了该数据集作为宝贵科学资源的潜力。第一篇论文中，多组学分析被用来将癌症驱动突变与蛋白质模式联系起来；第二篇论文深入研究了调控细胞信号传导和生理学的蛋白质修饰，揭示了不同肿瘤类型与DNA修复、代谢和免疫之间的关联。

这个泛癌症蛋白质基因组数据集将通过NCI癌症研究数据共享库公开发布。蛋白质组学数据可通过蛋白质组学数据共享库（https://pdc.cancer.gov/pdc/cptac-pancancer）访问（图1）。基因组和转录组数据可通过基因组学数据共享库（https://portal.gdc.cancer.gov）（图2）和癌症数据服务网站（https://dataservice.datacommons.cancer.gov/ ）访问。

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图1 来源于蛋白质组数据共享库

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图2 来源于基因组数据共享库

参考文献

[1] Li Y, et al. Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium. Proteogenomic data and resources for pan-cancer analysis. Cancer Cell. 2023 Aug 14;41(8):1397-1406.

[2] Geffen Y, Anand S, Akiyama Y, et al. Pan-Cancer analysis of post-translational modifications reveals shared patterns of protein regulation. Cell. August 14, 2023.

[3]Li Y, Dou Y, Leprevost FDV, et al. Pan-Cancer proteogenomics connects oncogenic drivers to functional states. Cell. August 14, 2023.

责任编辑：肿瘤资讯-Marie
排版编辑：肿瘤资讯-Marie