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【2022 ASCO壁报交流篇】BluePrint分类为基底型的黑人女性HR + 乳腺癌的全转录组学分析

2022年06月02日
编译:肿瘤资讯
来源:肿瘤资讯

2022年美国临床肿瘤学会(ASCO)年会将于6月3-7日于美国芝加哥正式召开,会议期间来自全世界肿瘤领域的专家教授及科研工作者将展示自己最新的科研成果,目前ASCO官网已公布会议摘要。

来自范德堡大学医学中心的Sonya A. Reid教授的一项BluePrint分类全转录组学分析结果表明,黑人女性乳腺癌患者中,HR+/基底型乳腺癌患者比例更高。HR+/基底型乳腺癌患者与TNBC更类似,预后更差,因此需要与HR+/管腔型乳腺癌区分治疗。

BluePrint分类为基底型的黑人女性HR + 乳腺癌的全转录组学分析

摘要号:517

题目

Whole transcriptomic analysis of HR+ breast cancer in Black women classified as basal-type by BluePrint.

背景

乳腺癌是黑人女性癌症相关死亡的主要原因,与白人女性相比,她们死于乳腺癌的可能性高41%。很少有研究评价肿瘤生物学差异是否导致这种结局差异。与三阴性乳腺癌(TNBC)相似,通过BluePrint基因组分析(HR +/Basal)归类为Basal-Type的激素受体阳性(HR +)肿瘤更具侵袭性,级别更高,在年轻黑人女性中比例过高,临床结局更差。TNBC与编码Duffy抗原的ACKR1低表达相关,并与较差的乳腺癌结局相关。考虑到HR +/基底肿瘤黑人女性的过度表达和较差的结局,我们按人种和亚型比较了差异表达基因(DEGs)。

方法

本研究包括2657例接受BluePrint检测的I-III期乳腺癌女性患者,是范德堡大学医学中心正在进行的BEST研究(5R01CA204819)或FLEX研究(NCT03053193)的参与者。在455例黑人女性中,315例患有管腔型(HR +/管腔型),140例患有基底型肿瘤(66例HR +/基底型和74例HR-/基底型)。纳入FLEX内的白人女性(n = 2202)作为HR +/管腔型(n = 1825)、HR +/基底型(n = 158)或HR-/基底型(n = 219)肿瘤的对照组。采用双尾比例z检验评估不同人种亚型比例的差异。采用Limma R软件包对全转录组数据进行差异基因表达分析(DGEA)。显著DEG的校正p值<0.05,绝对log2倍数变化>1。

结果

与白人女性(分别为7%和10%)相比,黑人女性的HR +/基底型(15%;p < 0.001)和HR-/基底型(16%;p < 0.001)肿瘤比例显著更高。在多维标度分析中,HR +/基底肿瘤与TNBC聚集,而不是与HR +/管腔肿瘤聚集。虽然比较HR+/基底型与HR +/管腔肿瘤的DGEA在黑人女性中产生了超过700个DEG,但当比较HR +/基底肿瘤与TNBC时,未发现DEG。在黑人女性(p = 0.81)和白人女性(p = 0.46)中,HR +/基底肿瘤中的ACKR1表达与TNBC相当。相反,在黑人(p < 0.01)和白人女性(p < 0.01)中,HR +/Basal肿瘤的ACKR1表达显著低于HR +/Luminal肿瘤。

结论

在这个种族不同的队列中,转录组学分析表明HR +/基底肿瘤在生物学上类似于TNBC,与种族无关。分子谱分析确定了HR +/基底肿瘤比例的人种差异,并强调了在临床试验中需要不同的代表。黑人女性HR +/基底肿瘤比例过高,且有证据显示预后较差,这些数据表明HR +/基底肿瘤患者不应与HR +/管腔肿瘤统一治疗,并强调进一步基因组分类对HR + 肿瘤患者的重要性。



责任编辑:肿瘤资讯-Joe
排版编辑:肿瘤资讯-Luka


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2022年06月04日
颜昕
漳州市医院 | 乳腺外科
乳腺癌的全转录组学分析