使用新辅助化学免疫疗法治疗非小细胞肺癌(NSCLC),可提高与患者远期生存率相关的病理完全缓解率(CPR)。本研究通过使用NADIM 试验中患者的基因表达数据分析肿瘤微环境,以确定预测 CPR 的生物标记物。
研究将患者依据病理缓解状态分为两组:病理完全缓解(CPR,肿瘤细胞完全坏死)和病理非完全缓解「non-CPR,包含大部缓解状态(MPR,肿瘤细胞90%以上坏死)和不完全缓解的状态(IPR,肿瘤细胞坏死率小于90%)」。
研究方法:
本研究共纳入NADIM临床试验中14名患者的基因数据,从治疗前的肿瘤整个切片中提取RNA ,使用Oncomine Immune Response Research Assay panel进行测序,用DESeq2和基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis ,GSEA)分析不同组和通路间基因的表达差异,CIBERSORTx 则被用于统计免疫细胞亚型的比例。
研究结果:
基因差异表达:有多达 25 个基因在 CPR 和非 CPR 患者间被鉴定为差异表达。其中与非 CPR 相比,有 17 种基因在CPR人群中被上调。参与 II 型干扰素信号传导(FASLG、CXCL13、CXCL10、CXCL9 和 IFNG)、NK 细胞标志物(NCR1、KIR2DL3、GNLY)或淋巴细胞富集(NKG7、GZMB)描绘了 CPR 患者治疗前肿瘤样本中的促炎表型。
基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis ,GSEA):GSEA 结果显示,在 CPR 患者中,与 TCR 共表达、淋巴细胞浸润、II 型干扰素信号传导和抗原加工相关的通路被上调,同时与肿瘤标记、增殖、PD-1相关的通路被下调。
免疫细胞组成:通过对组织样本的分析可以发现,CPR相较非CPR具有更多的免疫细胞种类和数目,其中包含滤泡辅助性 T 细胞、活化的 NK 细胞、M1 巨噬细胞、静息树突状细胞。
研究结论:
根据上面的研究结果,本研究共得到两条结论,其一为通过 RNA 测序在治疗前肿瘤组织中得到的促炎谱与 IIIA 期 NSCLC 患者新辅助学免疫治疗后的 CPR 相关;其二为高表达IFNG, GZMB, NKG7 and M1 macrophages这四者的治疗前肿瘤可预期新辅助化学免疫治疗后的病理完全缓解状态。
点评专家:英国阿伯丁大学病理系教授Keith M Kerr
西班牙Casarrubios教授团队所做的是免疫标记物与新辅助治疗NSCLC的预后相关性的研究。这项研究中主要关注在NADIM中可手术切除的3A期NSCLC患者中使用nivolumab单抗辅助治疗的效果(NADIM临床试验是一项多中心、开放性、单臂、Ⅱ期研究)。
在纳入研究的67位患者中,有26位(63.4%)达到了病理完全缓解状态(CPR,肿瘤细胞完全坏死);34位(82.9%)达到了大部缓解状态(MPR,肿瘤细胞90%以上坏死);而仅有7位(17.1%)是不完全缓解的状态(IPR,肿瘤细胞坏死率小于90%)。在对治疗前标本进行的RNA测序中发现,有25个基因在完全缓解和不完全缓解人群中表现出表达差异,IFNG,GZMB,NKG7和M1 macrophages这几个基因的高表达与CPR相关。
1. Marta Casarrubios, Immune gene signatures for predicting pathological response of NSCLC patients treated with neoadjuvant chemoimmunotherapy, ELCC2022
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