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【2018WCLC】非小细胞肺癌的免疫基因谱预测：ICON项目的免疫基因谱更新信息（MA06.02）

2018年09月15日

编译：肿瘤资讯编辑部

来源：肿瘤资讯

世界肺癌大会（World Conference on Lung Cancer，WCLC）是世界上最大的致力于肺癌和其他胸部恶性肿瘤的学术会议，是致力于肺癌研究的唯一一个全球性组织，每年一度，如期举行。2018年IASLC第19届即将于9月23-26日在加拿大多伦多举行，会议将有哪些亮点呢？【肿瘤资讯】带你抢先看2018WCLC的重要研究。

背景

我们过去的研究表明，更高层次的基因组复杂性与更多异质性抗原谱有关，抑制性T细胞谱和原位非小细胞肺癌（NSCLC）的术后复发也明确了肿瘤分子与免疫系统的交互作用及其对肿瘤生物学和患者生存的影响。我们启动了ICON项目（NSCLC的免疫基因谱）以预测早期NSCLC的分子和免疫蓝图及其如何通过多个途径影响患者的生存。本摘要将报告更新的基因组和免疫组分析结果。

方法

对Ⅰ-Ⅲ期NSCLC患者的组织活检样本进行用于突变分析的全外显子测序（WES）和RNA测序（RNAseq）、肿瘤新抗原预测和基因表达分析、T细胞受体（TCR）测序、基于飞行时间技术及多重免疫荧光染色的细胞计数。

结果

2016年-2018年，我们积累了127位患者，其中50例组织活检样本进行了WES、RNAseq、TCR测序和免疫表型分析。患者的中位年龄为66岁（范围：39-86岁），52%（26/50）为女性，76%（38/50）为前吸烟者。76%（38/50）的患者为非鳞癌而24%（12/50）为鳞癌。这些NSCLC患者中，34%（17/50）为Ⅰ期，30%（15/50）为Ⅱ期，34%（17/50）为Ⅲ期，2%（1/50）为Ⅳ期。90%的患者（45/50）都进行过手术治疗，中位随访时间为19个月，其中有15位患者出现复发。中位肿瘤突变负荷（TMB）为7.8mut/Mb，预测的肿瘤新抗原负荷为10/样本（范围：0-250），而预测的肿瘤新抗原负荷与TMB具有显著的相关性（r=0.41，p=0.002）。其中最常见的突变基因包括TP53、KRAS、CDKN2A、PIK3CA、EGFR、BRAF、GRIN2A和ATM；C->A颠换突变和C->T转换突变是最常见的突变类型。肿瘤组织的PD-1表达（p=0.003）和调节T细胞（CD4+/FoxP3+）浸润（p=0.02）明显高于正常组织，而CD3、CD8、颗粒酶B和CD45RO的表达则是肿瘤组织低于正常肺组织。

结论

相比于癌旁的正常肺组织，NSCLC肿瘤组织具有免疫抑制的微环境。本研究的临床数据足以在不同类别的NSCLC中开展基因和免疫谱分析比较。突变谱及肿瘤新抗原谱与以往的研究结果一致，而关于分子和免疫蓝图及其对患者生存的影响的研究仍在进行中。

责任编辑：肿瘤资讯-Elena chen