Session TypeMini Oral session
Session TitleMini Oral session: Breast cancer
摘要号66MO
英文标题66MO - Comprehensive analysis of genomic alterations in breast cancer (BC) across diverse populations using a large real-world database
中文标题66MO - 基于大型真实世界数据库对不同人群乳腺癌基因组改变的综合分析
讲者Vasily Aushev (San Carlos, US)
背景
乳腺癌（BC）在遗传和表型上具有异质性，其肿瘤特异性改变会影响患者的预后。迄今为止，大多数基因组研究主要报道欧洲（EUR）血统的患者，导致对其他血统的了解存在空白。在此，我们基于 Natera 专有的真实世界数据库中超过 30,000 名乳腺癌患者的数据，报告了按遗传血统分层的突变图谱。
方法
分析了来自乳腺癌患者（N=31,398）的全外显子组测序（WES）数据。作为 2019 年 6 月至 2024 年 11 月期间 Signatera™ 检测设计工作流程的一部分，对肿瘤组织进行了 WES。使用 Mutect2 和 VarScan2 算法进行变异检测。仅将非同义突变纳入发生率分析。使用 EthSeq 算法确定遗传血统，分为四组：非洲（AFR）、东亚（EAS）、欧洲（EUR）和南亚（SAS）。基于遗传血统的分析涵盖了发生率 ≥4% 的基因和发生率 ≥2% 的个体变异。
结果
患者的血统分布为：EUR 占 73.2%，AFR 占 10.5%，EAS 占 4.3%，SAS 占 1.6%，未知占 10.4%。
在激素受体阳性（HR+）乳腺癌中，PIK3CA 是总体突变频率最高的基因（36.9%）；AFR 患者中 ARID1A、GATA3 和 TP53 突变的发生率较高，而 EUR 患者中 AKT1 和 CDH1 突变的发生率较高（p<0.05）。
在 HER2+ 和三阴性乳腺癌（TNBC）亚型中，TP53 的突变最为频繁（分别为 47.9% 和 76.6%）。与 AFR 患者相比，EUR 患者在 HER2+ 亚型中的 PIK3CA 发生率较高，而在 TNBC 中的 TP53 突变发生率较低。
在变异位点水平上，PIK3CA H1047R 是所有三种亚型中最普遍的突变。患有 HR+ 乳腺癌的 AFR 患者中 GATA3 P409Afs*99 和 TP53 R213 变异的发生率较高，而 EUR 患者中 AKT1 E17K 和 PIK3CA E545K 的发生率较高（p<0.05）。在 HER2+ 和 TNBC 亚型中，个体变异在不同血统组之间无显著差异。
结论
我们的数据表明，乳腺癌的基因组图谱在不同血统群体之间存在差异。非洲裔和欧洲裔之间的体细胞改变不同，提示肿瘤生物学可能存在潜在差异。针对这些差异的治疗干预措施可能有助于减轻临床预后中的种族/民族差异。
排版编辑：肿瘤资讯-Jina
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