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ESMO Asia 2025|基于大型真实世界数据库对不同人群乳腺癌基因组改变的综合分析

12月08日
编译:肿瘤资讯
来源:肿瘤资讯
Session Type

Mini Oral session

Session Title

Mini Oral session: Breast cancer

摘要号

66MO

英文标题

66MO - Comprehensive analysis of genomic alterations in breast cancer (BC) across diverse populations using a large real-world database

中文标题

66MO - 基于大型真实世界数据库对不同人群乳腺癌基因组改变的综合分析

讲者

Vasily Aushev (San Carlos, US)

背景

乳腺癌(BC)在遗传和表型上具有异质性,其肿瘤特异性改变会影响患者的预后。迄今为止,大多数基因组研究主要报道欧洲(EUR)血统的患者,导致对其他血统的了解存在空白。在此,我们基于 Natera 专有的真实世界数据库中超过 30,000 名乳腺癌患者的数据,报告了按遗传血统分层的突变图谱。

方法

分析了来自乳腺癌患者(N=31,398)的全外显子组测序(WES)数据。作为 2019 年 6 月至 2024 年 11 月期间 Signatera™ 检测设计工作流程的一部分,对肿瘤组织进行了 WES。使用 Mutect2 和 VarScan2 算法进行变异检测。仅将非同义突变纳入发生率分析。使用 EthSeq 算法确定遗传血统,分为四组:非洲(AFR)、东亚(EAS)、欧洲(EUR)和南亚(SAS)。基于遗传血统的分析涵盖了发生率 ≥4% 的基因和发生率 ≥2% 的个体变异。

结果

患者的血统分布为:EUR 占 73.2%,AFR 占 10.5%,EAS 占 4.3%,SAS 占 1.6%,未知占 10.4%。

在激素受体阳性(HR+)乳腺癌中,PIK3CA 是总体突变频率最高的基因(36.9%);AFR 患者中 ARID1A、GATA3 和 TP53 突变的发生率较高,而 EUR 患者中 AKT1 和 CDH1 突变的发生率较高(p<0.05)。

在 HER2+ 和三阴性乳腺癌(TNBC)亚型中,TP53 的突变最为频繁(分别为 47.9% 和 76.6%)。与 AFR 患者相比,EUR 患者在 HER2+ 亚型中的 PIK3CA 发生率较高,而在 TNBC 中的 TP53 突变发生率较低。

在变异位点水平上,PIK3CA H1047R 是所有三种亚型中最普遍的突变。患有 HR+ 乳腺癌的 AFR 患者中 GATA3 P409Afs*99 和 TP53 R213 变异的发生率较高,而 EUR 患者中 AKT1 E17K 和 PIK3CA E545K 的发生率较高(p<0.05)。在 HER2+ 和 TNBC 亚型中,个体变异在不同血统组之间无显著差异。

结论

我们的数据表明,乳腺癌的基因组图谱在不同血统群体之间存在差异。非洲裔和欧洲裔之间的体细胞改变不同,提示肿瘤生物学可能存在潜在差异。针对这些差异的治疗干预措施可能有助于减轻临床预后中的种族/民族差异。

责任编辑:肿瘤资讯-Jina
排版编辑:肿瘤资讯-Jina

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