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靶向治疗早期进展的NSCLC免疫浸润特征和差异基因分析

10月01日
整理:肿瘤资讯
来源:肿瘤资讯

TKI已成为驱动基因阳性晚期NSCLC患者的标准治疗选择。然而,部分患者在TKI治疗后短期内即出现疾病进展,PFS远远短于临床试验相关数据。因此,有必要深入探索导致TKI早期进展的潜在机制。为此,有研究者基于37例患者转录组数据,分析了TKI治疗后早期进展NSCLC患者的差异基因和免疫细胞浸润特征。相关成果已于2024年ASCO大会上公布,本文对此进行简要解读和分享,希望能为医务工作者提供新的科研和临床参考,造福更多肺癌患者。

研究背景

尽管酪氨酸激酶抑制剂(TKI)的显著进展改善了多种驱动基因阳性非小细胞肺癌(NSCLC)的治疗结局,但这些患者几乎最终都会面临耐药性问题。此外,部分驱动基因阳性NSCLC患者对TKI表现出原发耐药性,在TKI治疗后短期内即发生肿瘤进展(PD)。

已有研究尝试探索导致TKI治疗后早期进展的潜在机制,目前主要关注患者的基因组特征。在此,本研究旨在探索与TKI长期反应者相比,TKI治疗后早期进展NSCLC患者的转录组特征。

研究方法

本研究纳入了携带EGFR突变或致癌驱动基因(ALK、ROS1、RET、NTRK)融合阳性的NSCLC患者,收集患者的治疗和生存结局数据。早期进展(EP)定义为TKI治疗后无进展生存期(PFS)<6个月,长期反应(LR)定义为PFS>18个月。在PD时至少进行一次组织活检,并对其进行了转录组RNA测序。研究者进一步探讨了EP和LR患者之间的转录组差异,进行了差异基因表达(DESeq2)、通路富集和MSigDb鉴定。通过CIBERSORT反卷积算法评估肿瘤浸润性免疫细胞的类型和丰度。

研究结果

从2015年到2022年,共有37例患者纳入本研究。入组患者中68%为女性,中位年龄为55岁(IQR 43-83)。18例携带EGFR突变(EP N=5,28%;LR N=13,72%),19例驱动基因融合阳性(EP N=10,52%;LR N=9,48%)(表1)。

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表1、入组患者的基线特征

M2型巨噬细胞是EGFR阳性和融合阳性PD时样本中最主要的肿瘤浸润性免疫细胞(分别占免疫细胞的33.5%和33.2%;图1)。在EGFR阳性和融合阳性患者中,EP和LR队列患者的免疫浸润成分没有显著差异。

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图1、EGFR阳性和融合阳性PD时样本肿瘤浸润性免疫细胞成分

DESeq2分析结果显示,与EGFR阳性LR患者相比,EGFR阳性EP患者的EPCAM(log2FC:-1.60,padj=0.01)、SOS1(log2FC:-1.18,padj=0.01)和JAK2(log2FC:-1.56,padj=0.02)表达水平显著降低(图2)。在融合阳性队列中,EP患者的FGFR3/4(log2FC:-3.5,padj=0.02)和MTAP(log2FC:-1.75,padj=0.03)表达水平显著降低(图3)。

3.png图2、EGFR阳性EP和LR患者的差异基因分析

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图3、驱动基因融合阳性EP和LR患者的差异基因分析

EGFR阳性肿瘤Hallmark基因通路分析结果显示,EP组中TNFα、IFNγ反应和KRAS通路的激活水平显著高于LR患者(NES:-1.72,p=0.03;NES:-1.78,p=0.02;NES:-2.07,p=0.01)。在融合阳性队列未发现任何差异激活的通路。

研究结论

免疫抑制性巨噬细胞是TKI治疗PD时肿瘤内最主要的浸润性免疫细胞,但与治疗有效时间无关。早期进展的NSCLC患者似乎具有不同的生物学特性,EGFR阳性患者具有肿瘤干性和免疫抑制性转录组学特征,融合阳性患者MTAP表达较低。

参考文献

本文主要参考Arianna Marinello, et al. Immune infiltrate characterization and differential gene expression by RNA-sequencing analysis in patients with oncogene-addicted NSCLC with early progression under targeted therapy. 2024 ASCO Abstract #8535. J Clin Oncol 42, 2024 (suppl 16; abstr 8535). 10.1200/JCO.2024.42.16_suppl.8535。

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评论
10月02日
苗军程
金乡县人民医院 | 肿瘤内科
靶向治疗早期进展的NSCLC免疫浸润特征和差异基因分析
10月02日
雷昕奕
永州市中心医院 | 胃肠外科
浸润特征和差异分析。
10月01日
罗双
广西中医药大学附属瑞康医院 | 肿瘤内科
免疫抑制性巨噬细胞是TKI治疗PD时肿瘤内最主要的浸润性免疫细胞,但与治疗有效时间无关。