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【2024 AACR】从未吸烟者的肺癌进化轨迹

04月09日
编译:肿瘤资讯
来源:AACR

美国癌症研究协会(AACR)年会是全球肿瘤学领域内历史悠久、极具影响力的国际会议之一,每年都会吸引来自世界各地的研究者、医生和科学家参加。2024年的第115届AACR年会于4月5日至10日在美国举行,展示肿瘤研究领域的最新进展、治疗创新以及前沿的科学发现。

本次大会上,一项研究结合Plackett-Luce排序模型对从未吸烟的肺癌患者进行了研究,以期阐述肿瘤进展与患者预后的关系。

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研究目的

通过对肺癌从未吸烟者(LCINS)发展过程中关键事件的顺序进行考察,揭示其进化路径。理解这些进化轨迹至关重要,因为它可以揭示与肿瘤进展和患者结果的重要关联。

研究方法

研究者采用了一种名为Plackett-Luce排序模型的数学方法,它被用来根据每个样本的拷贝数状态和突变癌细胞分数(CCF)数据,对频繁出现的拷贝数变异和驱动突变进行排序。这种方法使研究者能够为一组样本计算出一个总体顺序,并识别出具有不同进化模式的子集。
 
用于这项分析的数据集是Sherlock-lung全基因组测序数据集,该数据集经过筛选,只包括显示亚克隆扩张的样本。纳入标准是每个染色体拷贝至少有10个读数,且细胞性至少为30%。这一过程产生了一个包含458个不同组织学的LCINS样本的数据集。为了进行比较分析,还纳入了155个吸烟者的样本。

研究结果

研究结果显示,LCINS肿瘤有两个不同的子集,具有不同的进化轨迹。第一个子集被称为“基于损失”的子集,其特点是整个基因组复制(WGD)的发生频率较高,并且拷贝数损失在肿瘤进化早期更为常见。第二个子集被称为“基于增益”的子集,WGD发生频率较低,但通过拷贝数增益增加了倍性,这些增益比损失更为常见。尽管两条路径不同,但两个子集最终都达到了相似的整体拷贝数状态。
 
有趣的是,基于损失的子集具有更高的突变负担和更大比例的基因组改变,遵循的轨迹更类似于吸烟者。然而,两个子集的生存时间相似,这表明其他因素也可能在决定结果方面发挥作用。
 
研究还发现,特定的拷贝数事件定义了两条轨迹之间的差异。例如TP53和EGFR这样的驱动突变与更大的基因组不稳定性相关,而KRAS突变则与更稳定的基因组相关。具有某些基因早期克隆突变或特定拷贝数增益的样本表现出较短的生存时间。

研究结论

该研究为LCINS识别出了两条不同的进化轨迹。子群之间的差异以不同的拷贝数活动模式为特征。尽管存在这些差异,但两条轨迹都导致了相似的整体拷贝数状态和结果。早期驱动突变被发现显著影响基因组不稳定性和生存时间,强调了它们在肿瘤进化中的重要性和作为治疗靶点的潜力。这项研究为LCINS的多样化进化路径提供了宝贵的见解,并强调了肿瘤发展的复杂性。



责任编辑:肿瘤资讯-云初
排版编辑:肿瘤资讯-云初



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评论
04月09日
李建红
长治市潞州区中心医院 | 放射治疗科
努力学习服务百姓