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【2018ASCO抢先看】对致死性转移性乳腺癌进行全面的基因突变和免疫谱分析(ABS:1009)

2018年05月18日
编译:肿瘤资讯编辑部
来源:肿瘤资讯

美国临床肿瘤学会(ASCO)成立于1964年,是世界上规模最大,学术水平最高,最具权威的临床肿瘤学会议。2018年ASCO年会即将于6月1日至5日在芝加哥举办。今年的主题为“Delivering Discoveries: Expanding the Reach of Precision Medicine”。在本次ASCO年会上将迎来多项肿瘤领域的重磅研究,肿瘤资讯带您先睹为快。

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背景

转移性乳腺癌(MBC)是一类异质性大大疾病,对这类疾病的耐药机制和免疫逃逸相关机制对了解甚少。本研究对致死性MBC患者进行了全面对分子检测,包括原发灶和转移灶及其肿瘤免疫微环境(TME),T细胞受体表位。

方法

检测标本包括不同部位的转移病灶(182个转移灶,涉及22个转移器官,每个患者5-36个转移病灶),原发灶(6个),外周血ctDNA(来自10例患者,其中

5例为ER+/HER2-, 3例为ER+/HER2+, 1例为ER-/HER2+, 1例为ER-/HER2-)。分子检测的方法包括外显子测序(86个标本),全外显子测序 (168个标本), RNA 测序(61个标本),超深度靶向测序(243个标本),靶向测序 (70个标本)和免疫组化IHC检测 (102个标本)。对测序数据进行最先进的生物信息学分析。

结果

不同患者之间的肿瘤突变谱存在广泛差异(共检测到11,579个变异,中位变异数255.41 mut/患者),此外,同一患者不同转移病灶之间的变异也存在广泛差异 (中位变异数122 mut/转移灶);本研究检测到突变负荷大于TCGA数据库的突变负荷(中位数63.5 mut/原发灶,p = 4.927e-14)。根据突变谱的分布和预测新抗原将其分为树干突变 (每个患者的所有转移灶均出现)或分枝突变(仅见于部分转移灶),而非特有突变(仅见于患者的1个转移灶)。靶向测序的数据确认了所有患者(n=10)的肿瘤原发灶均含有树干突变,而ctDNA据转移器官而异。10例患者中,9例患者不同转移器官之间的拷贝数变异相似,除了1例ER+/HER2- 的患者,其转移灶携带1个共同的主克隆(1q 扩增/16q缺失),因此早期就出现亚克隆的进化。根据转移病灶是否携带相同的树干突变,分为不同系统进化的分枝突变,虽然不同病灶在进化过程中会出现既往未知的新突变。转移病灶携带有树干突变,然后不断进化出现新的分枝突变,称之为亚克隆。一个特定亚克隆要么拥有相同的免疫TME,要么1个器官上不同的转移病灶之间拥有不同的免疫TME。每个患者的TCR表位也携带有主克隆和亚克隆。TCR表位揭示了转移病灶的基因与适应性免疫反应共进化。

结论

本研究通过对致死性MBC患者的基因和免疫谱进行全面分析,显示出基因变异、TME特征和T细胞适应性免疫反应的异质性。

参考文献

http://abstracts.asco.org/214/CatView_214_S.html

责任编辑:肿瘤资讯-贾老师

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2019年07月22日
钱跃军
郑州大学附属郑州中心医院(郑州市中心医院) | 乳腺外科
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