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TMB(下)AACR大会上的免疫治疗生物标志物探索

2018年04月23日
作者:王一树
来源:王一树微信公众号

在刚刚结束的今年的AACR大会上,免疫治疗无疑是一个热点,所有的研究都包含了分子标志物的研究,但得到了不同的结果,未来这一领域的伴随诊断一定是一个热点,以找到更精准的获益人群。

Checkmate227研究,TMB高表达人群获益

CheckMate 227研究结果显示,在TMB高表达的人群,免疫治疗药物的联合(Nivolumab+ ipilimumab)相比化疗显著提升了患者PFS,HR=0.58降低复发风险42%,1年PFS提升3倍,且初步OS分析可以看到显著获益。结果同时发表在New England Journalof Medicine杂志。

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BMS此举并未一开始就在227研究中将TMB作为研究终点的标志物观察,而是修改研究方案加入TMB设计,在去年9月,与Foundation Medicine合作,将FoundationOne CDx用于TMB的检测。 

在本次AACR上,研究者证实了TMB作为标志物的在免疫联合治疗人群中有效性和重要性,在该研究TMB的cut off值选择了10,这也是基于一项CheckMate568研究的探索,并于同期在AACR上作了报告。

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哥伦比亚大学医学中心TMB大神Rizvi教授在讨论中强调了:“TMB的应用可以有效的鉴别出真正能够得到临床获益的患者,并且患者在治疗伊始选择一个全面的基因测序要比IHC,FISH或小Panel的测序更能得到后期治疗的帮助。

MSKCC的肿瘤学专家Matthew Hellmann教授也指出,“TMB可以作为独立的可靠的免疫治疗预测标志物。”

耶鲁大学的病理学家David Rimm教授认为,基于CheckMate227研究的阳性结果,TMB的检测可以尝试在临床广泛应用。

PD-L1再受质疑?Teff探索失败

我们可以看到在CheckMate568和CheckMate227研究中都能看到以TMB10 作为cut off值,高表达相比低表达人群PFS的显著获益。但值得一提的是,尽管前期研究认为PD-L1作为标志物依然很重要。但在CheckMate227研究中我们可以看到,在TMB和PD-L1都高表达的人群中比TMB高表达PD-L1阴性人群更为获益,该研究入组了很多PD-L1阴性的患者。这一点是TMB更加有效的一个佐证,也不是首个认为PD-L1不是最佳标志物的研究。

并且在这次的研究中也发现TMB和PD-L1的表达不存在一致性,也就是两者的表达无关联,是独立的个体。

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本次大会报道的另一项III期研究Keynote 189研究,Pembroluzumab联合化疗对比化疗方案,主要研究重点OS和PFS均获得阳性结果,尽管对PD-L1表达做了分层,但我们可以从结果看到,无论PD-L1的表达状态,包括PD-L1阴性的患者均可从免疫治疗药物中获益。在讨论中耶鲁大学的Roy Herbst教授表示PD-L1阴性患者PFS的提升无统计学意义(小于0.05了哦~~~),然而,我们来看下图,不仅P值小于0.05,OS还是有差异的呀,这是对PD-L1作为免疫治疗生物标记物挑战的再一次佐证。

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至于IMpower150研究中选择的Teff标志物,是PD-L1, CXCL9 and IFNγ三个指标的总和。罗氏估计也是在前期的POPLAR和OAK研究中发现了PD-L1不靠谱,又考虑到TMB的不便,多加了几个微环境指标,整了一个Teff出来,结果发现鸡肋了。不仅再次验证免疫治疗的获益无关PD-L1表达,也可以看到无关Teff表达,也就是低表达一样获益;并且我们可以发现高Teff表达的复发风险降低还不如高PD-L1的患者呢,也就是说三个标志物一起用,不如用一个。这说明此次标志物的探索没有止步,又排除了一个。

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平台诸多 作何选择?

前期BMS的诸多研究使用了Foundation Medicine 的检测平台包括FoundationOne和已经被FDA获批作为实体瘤伴随诊断的F1CDx(【肿瘤界里程碑!】NGS被FDA批准为肿瘤检测伴随诊断!),我们知道其平台做了很好的验证性研究,所选基因的TMB结果和WES检测的TMB结果一致,也就是这个平台是靠谱的。

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而BMS上周刚刚宣布了和illumina的合作,用以进行包含TMB与MSI在内的免疫治疗生物标记物的探索,但TruSight Oncology 500 panel和FoundationOne不是一个平台,因此或许就不选择10作为cut off值。目前有太多的公司和实验室在做TMB平台,在目前并无TMB规范化的时代,怎样的平台才靠谱?至少应该做一致性分析。

我们看下边的研究,对比了不同Panel的TMB检测高低与疗效(PFS)的关系。首先是Cancer SelectR的76个基因Panel,无统计学差异(p=0.6);Qiagen的160个基因panel,有统计学差异(p=0.04);Cancer SelectR的195个基因Panel,无统计学差异(p=0.1);Foundation Medicine的315个基因Panel,得出了显著统计学差异(p=0.05)。

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在今年的AACR上还报道了进行PGDx的NGS测序平台检测TMB进行早期肺癌新辅助Nivolumab治疗的有效性研究,并同期发表于NEJM,运用的是WES全外显子测序。该研究不仅是免疫治疗在新辅助的又一项有效验证,也是PGDx平台的有效性证实。另外一提,PGDx公司也在今年一月得到BMS的B轮融资,共同提供免疫治疗整体解决方案。(联姻提供整体解决方案:二代测序公司PDGx获BMS公司B轮融资

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Foundation Medicine的TMB将从LDT向CDx之路进行, 但目前也可应用于临床,作为F1CDx报告的一部分,其已经有超过一万例的标本经验。且罗氏也选择了FoundationMedicine的bTMB平台进行血液ctDNA的TMB分析(继TMB后又放大招!血检ctDNA作为免疫治疗标志物?),计划将推为另一个免疫治疗药物Atezolizumab的伴随诊断,如果成功极有可能是第一个血液检测的TMB诊断方法。

免疫治疗路漫漫,人群筛选刚刚开启,TMB或许是一个很好的Biomarker,但我们可以看到还存在很多的问题,比如验证性,比如临床药物指导的前瞻性研究,比如不同平台的测序深度与Cut off值比如检测周期等,这些会对临床使用带来一些困惑。也或许在探索的路上我们还会找到更合适的Biomarker,我们知道免疫治疗的长期获益性,但获益人群还是有限,如何能精准的找出这一类获益人群,达到真正的长期生存甚至治愈?精准诊断将开启新的一步。