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【NGS+IO】Foundation Medicine的血检TMB将作为免疫治疗一线伴随诊断

2017年09月18日
来源:王一树

 血检TMB作为伴随诊断

上周,Foundation Medicine表示其血检TMB作为在罗氏免疫治疗药物Tencentriq(Atezolizumab)在一线治疗NSCLC(非小细胞肺癌)的伴随诊断。

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该平台用于两项临床研究,一个是单臂的B-F1RST,研究者回顾性分析了一线Atezolizumab治疗后血检TMB。

同时另一个前瞻性研究BFAST,选择了高TMB的NSCLC患者一线使用Atezo治疗,或对ALK/RET突变的患者选择一线使用Alectinib治疗。

近年来免疫检查点抑制剂的进展很快,多样化的Biomarker在探索当中。免疫组化检测PD-L1的表达目前最受认可,但由于其与疗效未必正相关,FDA将其批准为补充诊断,也就是测或者不测PD-L1都可以对肿瘤进行免疫治疗。例如Atezo被FDA批准治疗膀胱癌无论PD-L1表达。

有调查显示,缺乏精准标志物可能会导致药物的过度处方,包括一些可能从靶向治疗甚至化疗获益的患者。基于此,对于Biomarker的探索非常有必要。

Foundation Medicine的TMB之路

Foundation Medicine的TMB检测策略从2016年初开始,在FoundationOne检测开始不久,加入了TMB的计算。

研究者原先发现全外显子测序高突变的肿瘤患者对免疫治疗响应较好,而Foundation One展示了作为315个基因的检测TMB结果与全外显子检测的高一致性。文章发表于Nature杂志。

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Foundation Medicine的肿瘤免疫负责人Dave Fabrizio谈到他们从标本检测转向寻找非侵入式的血检方法,这才使得该平台用于了罗氏的BFAST研究。

FoundationMedicine还有一个62个基因cfDNA检测的平台在去年春季已经上市,但目前还没有分享有关TMB血检策略的信息,是否可以代替大panel的基因检测计算。

上周末的ESMO大会上,Foundation Medicina展示了bTMB在BFAST的应用,并将以此数据去获得FDA伴随诊断的批准。

BFAST数据分析

BFAST研究在刚刚结束的ESMO大会上进行了壁报展示,bTMB选取10毫升血浆,进行394个基因的体细胞突变的检测,该研究对高TMB的定义选择了2个cut off值,分别是10和16,与组织标本检测的TMB进行一致性比对,结果显示,bTMB的精确度与准确度验证性分析需要每20ng至少1%肿瘤含量测量cfDNA。检测bTMB的Cutoff值在8-20之间可以达到高精确度与敏感度。

微信图片_20170918102427.jpgbTMB的检测前瞻性用于一线治疗NSCLC患者的国际多中心研究BFAST,旨在比较抗PD-1治疗与基于铂类的化疗。在OAK和POPLAR的研究的783例患者也回顾性的用到了bTMB检测,比较Atezo与多西他赛标准治疗的OS获益。结果显示bTMB的表达和Atezo疗效呈强关联。微信图片_20170918102430.jpg

此外,研究发现bTMB的表达与PDL1的表达并未显示出关联关系,这提示两者是独立的预测标志物。

还有哪些公司在做非侵入性TMB检测

Personal Genome Diagnostics宣布在研发非侵入性二代测序平台,名为MutatorDETECT,可以通过检测cfDNA来计算TMB,用来鉴定出可能从免疫检查点抑制剂中获益的患者。

Guardant Health的液体活检比Foundation Medicine还早,可针对500个基因的ctDNA检测来进行TMB的计算。

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OmniSeq宣传有更宽泛的检测手段筛选免疫获益人群,进行以下不同检测,包括:RNA-seq,PD-L1,PD-L2,TMB及MSI。

药厂的竞争

罗氏并不是唯一一家免疫治疗Pipeline中涉及TMB的公司。

FDA已经获批了Merck的免疫检查点抑制剂Keytruda(Pembrolizumab)在MSI-H及dMMR患者中使用,这是首个针对Biomarker而不是发病部位获批的药物。而MSI-H及dMMR的肿瘤细胞通常DNA修复受损,该机制通常会导致TMB检测高表达。(大事件!FDA今日首批根据Biomarker而不根据瘤种的肿瘤疗法)

BMS的Nivolumab已经有研究结果(CM026)发表于NEJM上,显示出Nivo的治疗结果与患者TMB表达相关。

BMS也和Foundation Medici ne进行了战略合作。

责任编辑:肿瘤资讯-Ruby