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【2016 SABCS】三阴性乳腺癌基因组的免疫编辑

2016年12月02日

编译：郭晓芳

来源：肿瘤资讯

背景：

肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)在乳腺癌中，尤其是TNBC和HER2阳性乳腺癌的乳腺癌中是预后良好的标志。现有两种相竞争的假说用来预测TILs和基因组异质性的相对关系。一方面，强大的免疫反应可能通过消除免疫原性克隆，来“修剪”肿瘤内的异质性，达到一个相对平衡,因此有更好的预后，相反肿瘤逃逸可能导致更大的异质性克隆和基因组的复杂性。在某些癌症,发现的肿瘤抗原比预期出现的肿瘤抗原少，也表明免疫可介导消除肿瘤克隆(Rooney et al.2015)。研究还显示免疫细胞浸润程度与肿瘤内克隆异质性成反比(Morris et al.2016)。另一方面,不稳定基因组和突变负荷越大的肿瘤有更大的克隆异质性,从而有更多的肿瘤抗原和免疫浸润。事实上,已经在各种肿瘤有足量的数据显示整体突变负荷与肿瘤微环境中的免疫活动存在正相关关系(Brown et al. 2014, Rooney et al. 2015, Schumacher and Schreiber 2015)。

方法：

我们评估了这两个相互竞争的假设，并研究在不同的乳腺癌亚型中，基因组复杂性与免疫基因表达之间的关系。我们使用前所述的免疫宏基因表达(DNA芯片 n = 655)作为在TCGA数据集中估计免疫浸润的方式(RNA系列 n = 1215)。我们在119种经典的癌症基因的突变分布中，对比了其体细胞突变、突变数、肿瘤抗原负荷、克隆异质性指标，并且比较了良好预后和不良预后（对应于高免疫浸润和低免疫浸润）的TNBC(n = 208) 的12种肿瘤传导通路。

结果：

对所有乳腺癌亚型进行了分析后，观察到变异数和免疫宏基因的表达有正但弱相关关系 (P = 0.08)。在TNBC中通常有更多的突变数和更高的免疫浸润。当对TNBC进行单独分析时,预后良好的TNBC有高免疫浸润和低突变总数(P = 0.021),与及低的预测肿瘤抗原数(P = 0.035)。在预后良好TNBC中克隆的异质性也低(P = 0.001)。变异突变等位基因频率和免疫宏基因表达有明显的负关系。CASP8突变是具有高免疫浸润的TNBC中最丰富的突变(P = 0.007)。

结论：

在TNBC中肿瘤高免疫浸润与低肿瘤异质性相关，提示肿瘤在免疫编辑下，肿瘤和免疫监测之间达到相对的平衡。手术切除原发肿瘤，会导致免疫功能增强，使高TIL的TNBC有更好预后。低免疫浸润的TNBC有更大的克隆异质性和突变负荷，可能由免疫监测逃逸所致。如前所述，在高high-TIL TNBC中，CASP8突变可能是逃避肿瘤细胞死亡的一种方式。

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