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亚裔结直肠癌测序发现新频发突变位点

2015年04月02日

本文是香港中文大学的一项关于亚洲结直肠癌患者基因组变化的研究，本研究结果可为以后亚裔结直肠癌患者个体化治疗提供更多的参考。

背景：

通过二代测序技术发现新的结直肠癌频发突变基因。但基因组数据尚未应用于结直肠癌患者的预后分析。

目标：

筛选与结直肠癌预后相关新的频发体细胞突变基因。

方法：

对22名结直肠癌患者肿瘤组织进行外显子测序，识别体细胞突变基因；并且在另外160例患者中通过靶向捕获测序技术对187个与信号通路相关的频发突变基因进行证明。

结果：

发现了7个显著突变的基因，包括APC、TP53、KRAS和SMAD4四个已报道基因，和CDH10、FAT4和DOCK2三个新发现的频发突变基因。在本研究群体中新发突变基因存在比较广泛（约占6-14%）并且比其他非沉默突变更高。5个基因（CDH10、COL6A3、SMAD4、TMEM132D）与预后相关，其中一个或多个基因突变与良好预后相关，并独立于TNM分期。突变组中位生存时间80.4个月而野生型组仅为42.4个月（p=0.0051）。这些基因的预后特点通过癌症基因组图谱研究得以证实。

结论：

应用二代测序技术识别了三个结直肠癌新发突变基因，其中一个与预后相关的基因突变独立于TNM分期。

研究的重点

既往研究：

1.通过Sanger法和二代测序法发现了白人结直肠癌中的常见突变基因

2.结直肠癌患者预后主要与TNM分期相关

3.BRAF突变和微卫星稳定状态同样能够预测结直肠癌患者的预后

新发现：

1.在亚洲人群中发现了3个新的频发突变基因，CDH10,、FAT4和DOCK2。

2.证实了CDH10、COL6A3、SMAD4、TMEM132D、VCAN五个基因的突变是独立于TNM分期的预后预测因素。

可能影响临床实践的因素：

1.新发现的频发突变基因可以增加目前药物的靶点，便于以后靶向药物的开发。

2.五个与预后相关的基因将帮助对早期结直肠癌患者进行分层，并预测临床结局。

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