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2025 ASCO | NCI-MATCH试验中少见癌症患者的匹配ctDNA和组织的综合基因组分析

05月25日

编译：肿瘤资讯

来源：肿瘤资讯

专场：DEVELOPMENTAL THERAPEUTICS—MOLECULARLY TARGETED AGENTS AND TUMOR BIOLOGY

摘要号：3006

摘要类型：Oral Abstract Session

英文标题：Comprehensive genomic profiling of matched ctDNA and tissue from patients with less common cancers enrolled in but not eligible for a treatment arm of the NCI-MATCH trial.

中文标题：NCI-MATCH试验中入组但不符合治疗组条件的少见癌症患者匹配ctDNA与组织的综合基因组分析

作者：Biswajit Das，Frederick National Laboratory for Cancer Research, Frederick, MD

研究背景

在NCI-MATCH临床试验（NCT02465060）筛选过程中，5961例晚期癌症患者接受了二代测序（NGS）评估。其中约60%为少见肿瘤（即非结肠癌、直肠癌、乳腺癌、非小细胞肺癌或前列腺癌）。多数患者未检出研究要求的靶向突变（MOI），因而未能接受试验性治疗。对这些患者的血浆样本进行分析可揭示循环肿瘤DNA（ctDNA）特征，或能为少见癌症类型的临床相关突变ctDNA检测提供指导。本研究报告了NCI-MATCH筛查患者亚群的ctDNA与匹配肿瘤组织的分子特征。

研究方法

采用TSO500 ctDNA v2检测（523基因）对入组时采集的血液样本进行ctDNA综合基因组分析，使用Illumina NovaSeq 6000测序平台。匹配肿瘤组织采用Oncomine Comprehensive Assay v2（143基因panel）测序。以组织检测为金标准，计算血浆ctDNA与组织筛查的靶向突变阳性符合率（PPAref_tumor）。

研究结果

我们在少见肿瘤队列中检测了2253例患者。2194份样本可评估，通过率98.6%，失败率1.4%。进一步分析了样本量较大（n＞35）的5种肿瘤组织学类型：胆管癌（CCA，n=90）、小细胞肺癌（SCLC，n=59）、食管腺癌（EAC，n=37）、胰腺导管腺癌（PDAC，n=232）和唾液腺癌（SGC，n=47）。这五种组织学类型的总体PPAref_tumor为83.4%（范围：76.5%-97.9%）。在一致性<75%的患者中，中位肿瘤分数（基于最大体细胞等位基因频率）显著低于一致性≥75%的样本（0.37% vs 6.49%）。各癌种高频突变基因分别为：CCA中TP53、KRAS和IDH1；SCLC中TP53和RB1缺失；EAC中TP53、KRAS和ERBB2扩增；PDAC中TP53和KRAS；SGC中TP53。此外，ctDNA还检出多个仅见于液体活检的临床相关突变，如CCA中的IDH1，以及多种组织学类型中的BRAF、TP53和PIK3CA突变。仅在ctDNA中检测的微卫星不稳定性（MSI）在SCLC中最常见，其次为CCA。

研究结论

NCI-MATCH试验中少见肿瘤在代表性组织学类型中的一致性达83.4%，与常见癌症研究中临床相关MOI的一致性相当。液体活检或可作为临床试验中靶向治疗匹配的可行筛查方案，尤其当肿瘤活检不可行或无法评估时。部分突变仅在ctDNA中检出，可能提示少见癌症患者多发病灶存在肿瘤异质性。

责任编辑：肿瘤资讯-Nydia
排版编辑：肿瘤资讯-Nydia