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2025 ASCO|在ctDNA液体活检基础上增加ctRNA检测可使可干预性诊断率提升36.7%

05月24日
编译:肿瘤资讯
来源:肿瘤资讯

专场:【Rapid Oral】Developmental Therapeutics—Molecularly Targeted Agents and Tumor Biology

摘要号:3016

英文标题:Clinical utility of circulating tumor RNA (ctRNA) in a combined circulating tumor DNA (ctDNA) and ctRNA next-generation sequencing (NGS) pan-cancer liquid biopsy assay.

中文标题:循环肿瘤RNA(ctRNA)在ctDNA/ctRNA联合新一代测序(NGS)泛癌液体活检中的临床应用价值

第一作者:Jonathan Poh, Lucence Diagnostics Pte Ltd, Singapore, Singapore

研究背景

液体活检在临床实践中日益广泛地应用于肿瘤治疗方案选择、疾病监测和早期检测。鉴于单纯DNA检测方法在基因融合检测方面存在固有局限性,现行指南已推荐将RNA与DNA测序联合作为检测FDA可干预基因融合的标准方案。然而,ctRNA联合ctDNA检测的临床价值尚未通过大规模研究量化。本研究首次通过大规模真实世界研究,评估ctRNA与ctDNA联合检测在单次液体活检中的临床应用价值。

研究方法

2021年6月至2024年12月期间,在美国和亚洲两家CAP认证且CLIA认证的实验室中,对来自979例癌症患者的1,007份连续血浆样本采用ctDNA/ctRNA联合检测技术(LiquidHALLMARK)进行真实世界液体活检检测。该基于扩增子的联合检测可分析ctDNA中80个基因的基因组变异及ctRNA中最多37个基因的表达。本分析仅纳入基因融合事件(包括MET外显子14跳跃突变)。经验证,ctDNA和ctRNA检测panel对基因融合的检测下限分别为0.5%和10个拷贝。

研究结果

在30种癌症类型的样本中,99.6%(1003/1007)成功完成ctRNA分析,其中肺癌、前列腺癌、乳腺癌、结直肠癌和胰腺癌占临床检测量的84.2%。在7.8%(78/1003)的病例中检出涉及11个基因(ALK、RET、ROS1、MET、NRG1、NTRK1、FGFR2、FGFR3、ESR1、ERG、ETV4)的融合事件,主要见于前列腺癌和肺癌,亦见于乳腺癌、胆管癌、甲状腺癌、肝癌和膀胱癌。共检出80个融合变异,其中25个由ctDNA和ctRNA共同检出,而ctDNA和ctRNA分别独立检出27个和28个融合。在28个ctRNA特异性检出的融合中,5个未被ctDNA panel覆盖(1例ATP1B1-NRG1、1例ESR1-CCDC170、1例ESR1-AKAP12和2例SLC45A3-ERG)。11/28的ctRNA特异性融合具有临床可干预性,均发现于肺癌患者,其中2例同时存在其他肺癌驱动突变,提示潜在的靶向治疗耐药机制。其余9例中有3例接受了融合匹配靶向治疗,2例可获得疗效评估的患者均达到部分缓解。总体而言,联合ctRNA分析使融合变异总检出率提升53.8%,可干预性融合检出率提高36.7%。

研究结论

本项首个大规模研究表明,在ctDNA液体活检基础上增加ctRNA检测可使可干预性诊断率提升36.7%,能揭示潜在耐药机制,并可扩展检测范围至传统DNA方法难以检出的基因融合。这些发现支持在组织和液体样本中均推荐采用DNA/RNA联合检测进行融合基因分析。

责任编辑:肿瘤资讯-明小丽
排版编辑:肿瘤资讯-明小丽



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评论
05月25日
王根彩
丰县人民医院 | 肿瘤外科
液体活检在临床实践中日益广泛地应用于肿瘤治疗方案选择、疾病监测和早期检测。