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在晚期NSCLC中基于外周血NGS全面基因组分析检测可操作变异的可行性

11月13日

整理：肿瘤资讯

来源：肿瘤资讯

引言：基因检测可发现NSCLC中可操作靶点和预后标志物，实现精准诊疗并改善患者预后。NSCLC基因检测通常是基于组织标本进行的。然而，由于各种原因，晚期NSCLC经常难以获取足够的组织标本用于病理分析和基因检测。因此，有必要探索在晚期NSCLC中基于外周血检测可操作变异的可行性。为此，来自香港大学李嘉诚医学院的研究者获取了72对匹配的NSCLC患者外周血和肿瘤组织，验证外周血全面基因组分析的准确性和一致性，相关结果已在2024年ELCC大会上公布，本文对此进行简要解读和分享，希望能为医务工作者提供新的科研和临床参考，造福更多肺癌患者。

背景

全面的基因组分析（CGP）有助于帮助非小细胞肺癌（NSCLC）患者发现可操作靶点和预后标志物，实现精准诊疗并改善患者预后。既往NSCLC基因检测通常是基于肿瘤组织标本。然而，由于各种原因，NSCLC经常难以获取足够的组织标本用于病理分析和基因检测，尤其是在复发性和晚期NSCLC中。此外，肿瘤组织CGP漫长的结果反馈周期可能会影响及时的治疗决策。液体活检可以在样本量和周转时间方面弥补组织标本的不足。然而，由于循环肿瘤DNA（ctDNA）样本不足，液体活检在检测可操作变异方面也存在一定的局限性，本研究旨在探索ctDNA在晚期NSCLC中基于外周血NGS-CGP检测可操作变异的可行性，并验证其准确性和与组织标本的一致性。

研究方法

从2021年7月开始，本研究与香港正在进行的晚期NSCLC多中心前瞻性精准肿瘤计划研究共同招募患者。使用FDA批准的Foundation One CDx和Foundation One Liquid CDx进行CGP检测分析。通过阳性一致性百分比（PPA）评估液体活检结果的准确性。用Pearson相关法计算组织和液体活检检测得到的肿瘤突变负荷（TMB）相关性。

结果

对72例外周血和组织CGP匹配的患者进行了分析。全队列患者中位年龄为69岁。71%的患者外周血ctDNA样本的肿瘤分数（TF）评分<10%。ctDNA TMB和肿瘤组织TMB的平均值分别为5.5 muts/Mb和6.1 muts/Mb。47%（n=35）的患者携带ESCAT I级可操作突变。报告的可操作突变包括：ALK融合（n=1）、BRAF V600E（n=2）、EGFR L858R（n=17）、EGFR19号外显子缺失（n=13）、KRAS G12C（n=1）和MET 14号外显子剪切位点突变（n=1）（图1）。本研究中配对队列可操作变异的PPA为71%（图2）。然而，液体活检和肿瘤组织TMB之间的相关系数为0.56，PPA为60%（图3）。

9-图1.png 图1、本研究中可操作变异瀑布图 9-图片2.png

图2、不同可操作突变在组织和外周血标本之间的阳性一致性百分比 9-图片3.png

图3、组织和外周血标本TMB之间的相关性

结论

本研究证实了在无法进行肿瘤组织活检时，使用外周血ctDNA检测临床可操作变异的潜力。然而，基于ctDNA分析的TMB数据准确性不足。

参考文献

本文主要参考Elaine Ko, et al. Actionable mutations in matched liquid and tissue biopsy next-generation sequencing. 2024 ELCC Abstract #45P; Annals of Oncology (2024) 9 (suppl_3): 1-53. 10.1016/esmoop/esmoop102569。

声明：本文由阿斯利康提供支持，仅供医疗卫生专业人士参考

审批编号：CN-1411983 过期日期2025-1-29

责任编辑：肿瘤资讯-Bear
排版编辑：肿瘤资讯-liguo.zhu