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携带MET 14号外显子Y1003突变的NSCLC临床与分子特征

10月17日
整理:肿瘤资讯
来源:肿瘤资讯

引言:MET 14外显子跳跃突变(METex14)类似物(Y1003)是MET 14号外显子膜旁结构域内的一种罕见突变,具有与METex14类似的功能。目前已有多种MET抑制剂获批用于METex14阳性NSCLC患者,有必要对Y1003的分子特征和治疗意义进行探索。为此,有研究者基于超4万例NSCLC数据,分析了Y1003突变特征和治疗潜力。相关结果已在2023年WCLC大会上公布,本文对此进行简要解读和分享,希望能为医务工作者提供新的科研和临床参考,造福更多肺癌患者。

背景

     MET Y1003突变是METex14类似物,也是MET 14号外显子膜旁结构域内的一种罕见突变,可导致泛素蛋白连接酶c-Cbl的结合能力受损,从而增加致癌性MET酪氨酸激酶受体的稳定性和MET通路的持续激活。

     近年来,随着多项临床研究的突破,已有多种MET抑制剂获批用于METex14阳性NSCLC患者。考虑到Y1003与METex14在理论上具有相似的功能,有必要对Y1003的分子特征进行探索,并对比Y1003与METex14或MET野生型(WT)NSCLC肿瘤的分子和免疫微环境。

研究方法

     收集40179例在Caris Life Sciences进行DNA(592 Gene Panel,NextSeq,全外显子组测序,NovaSeq)和RNA(全转录组测序,NovaSex)二代测序的NSCLC患者和分子数据。通过DNA测序确定Y1003突变,通过WTS确定METex14。通过单样本基因集富集分析估算通路富集得分,并使用quanTISeq算法估计肿瘤微环境细胞丰度。使用Mann-Whitney U、Fisher精确检验、Kruskal-Wallis检验、卡方检验和t检验进行统计分析,并针对多重假设检验进行校正。

结果

     在40179例NSCLC中,共检出MET Y1003突变患者28例(0.07%),METex14患者711例(1.77%)。Y1003队列患者的中位年龄为78.5岁,主要组织学类型为腺癌,男女比例大致相等(表1)。Y1003最常见的突变类型是Y1003H,Y1003常见的共变异基因包括STK11、NF2和FBXW7。Y1003和METex14阳性肿瘤中MET mRNA表达量平均都增加了约3倍,且均常见MDM2和CDK4的共扩增(拷贝数变异[CNV]>6),这也导致了MDM2基因表达量增加。与METex14类似,携带Y1003的肿瘤PD-L1(22c3)肿瘤比例评分(TPS)>1%的比例显著更高,但与WT肿瘤相比,高肿瘤突变负荷(TMB>10 Mut/Mb)的比例有所降低。携带Y1003和METex14的肿瘤均有免疫和炎症反应通路、PD-L2和IDO1等免疫检查点以及M2型巨噬细胞浸润相关的基因富集。

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表1、对比Y1003突变、METex14以及MET野生型NSCLC患者临床病理及分子特征

结论

     本研究是分析MET Y1003突变的最大规模研究,并对比了METex14肿瘤的分子特征。与METex14一样,Y1003常与MDM2和CDK4共扩增,并与潜在治疗靶点IDO1表达增加有关。Y1003还与高度免疫原性的肿瘤微环境有关。需要进一步评估Y1003患者接受分子靶向治疗的可能性。


本文主要参考S. Y. Kim, H. G. Narvel, N. Gandhi, et al. P1.12-08 Characterization of MET Exon 14 Skipping Analog (Y1003) in Non-Small Cell Lung Cancer (NSCLC)[J]. Journal of Thoracic Oncology, 2023, 18(11, Supplement): S210-S211。


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责任编辑:肿瘤资讯-Bear
排版编辑:肿瘤资讯-Julian