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【2019ASCO抢先看】向阳教授团队:ctDNA分析揭示上皮性卵巢癌基因组图谱

2019年05月20日
编译:肿瘤资讯
来源:肿瘤资讯

美国临床肿瘤学会(ASCO)成立于1964年,是世界上规模最大、学术水平最高、最具权威的临床肿瘤学会议。2019年ASCO年会即将于5月31日至6月4日在芝加哥举办。今年的主题为“Caring for Every Patient, Learning from Every Patient”。本次ASCO年会上,在妇科肿瘤领域,来自北京协和医院的向阳教授团队为我们带来了ctDNA分析揭示上皮性卵巢癌基因组图谱的研究结果,【肿瘤资讯】带您先睹为快。

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向阳
教授、博士生导师

现任中国医学科学院中国协和医科大学北京协和
医院妇产科学系副主任
国际滋养细胞肿瘤学会执行主席
中华医学会妇科肿瘤分会副主任委员
中国医师协会妇产科分会妇科肿瘤专业委员会主任委员
中国医师协会整合医学分会妇产疾病整合专业委员会主任委员
中华医学会妇产科学分会委员
中国抗癌协会妇科肿瘤专业委员会常委
北京医学会妇科肿瘤分会主任委员
北京医学会妇产科分会副主任委员
北京医师协会妇产科分会副会长
主要致力于妇科肿瘤的临床及基础研究

摘要编号:5543

Circulating tumor DNA analysis to reveal genomic profiles for epithelial ovarian cancer

背景

有关上皮性卵巢癌(EOC)中的循环肿瘤DNA (ctDNA)的分析研究既往已有报道,但是其样品量或基因量均有限。在这里,我们报道了使用1021个基因组的靶向测序对上皮性卵巢癌队列中的ctDNA进行分析。

方法

收集入组的上皮性卵巢癌患者未治疗的肿瘤组织和血液样本。利用匹配的组织DNA(tissue DNA)和ctDNA中的1021个基因NGS panel来鉴定以白细胞DNA作为种系对照的体细胞突变。

结果

在所有65个组织和53个(81.5%)ctDNA中鉴定出突变。中位数ctDNA突变等位基因频率为2.5%,范围为0.1%~36.2%。在ctDNA中观察到组织衍生突变中位数为66.7%(12.5%~100.0%)。此外,还有91个ctDNA私有突变(private mutations),包括TP53 基因突变。ctDNA分析中最常见的突变基因是TP53(55.4%)、PIK3CA(13.8%)和ARID1A(12.3%),与组织分析一致(TP53PIK3CA ARID1A 突变分别为60.0%、26.2%和20.0%)。高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)存在TP53(37/42)突变,卵巢透明细胞癌中存在PIK3CA(10/11)和ARID1A(8/11)突变,低级别浆液性卵巢癌中存在BRAF(4/5)突变,子宫内膜样癌中的PIK3CA(3/5)、ARID1A(2/5)和PTEN(2/5)被发现是不同亚型上皮性卵巢癌中ctDNA中最常见的遗传突变,上述突变位于不同的信号通路中,提示着不同的发病机制。总共有90.5%(38/42)的高级别浆液性卵巢癌为ctDNA阳性,而其他上皮性卵巢癌亚型为65.2%(15/23)(P = 0.012)。此外,56.5%(13/23)的I~II期上皮性卵巢癌是ctDNA阳性,而III期的为94.7%(36/38)(P = 0.002)。未观察到ctDNA阳性与其他临床特征之间的关联,包括病理分化、CA125、病变密度(实性 vs 囊实性和囊性)。多变量分析表明FIGO III期(P = 0.008)是ctDNA检测的独立预测因子。

结论

总之,上皮性卵巢癌的基因组特征可以解释肿瘤的发生机制并鉴定该疾病中的潜在治疗靶标。

参考文献

Xiang Yang ,  Zhu Shan , Wang Weiran , et al.Circulating tumor DNA analysis to reveal genomic profiles for epithelial ovarian cancer[EB/OL].(2019-05-16)[2019-05-20].http://abstracts.asco.org/239/AbstView_239_252907.html


责任编辑:Ella


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