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肿瘤圈必看!TCGA在Cell的牛文,妥妥的Milestone!

2018年04月07日
作者:王一树
来源:王一树微信公众号

发表于2018年4月5日CELL杂志的妥妥牛文,将是又一个Milestone!TCGA研究组总结了在33个不同瘤种的10个关键信号转导通路对细胞改变的影响。这些通路包括了细胞信号转导,myc,Notch和β-catenin/ Wnt通路。

通过研究了9000多个肿瘤标本的突变、拷贝数变化、mRNA表达和DNA甲基化数据,研究人员发现89%的肿瘤至少有一种驱动突变,57%的肿瘤至少有一种途径改变,可能是现有药物的潜在靶点进行靶向药物治疗。基于他们的信号通路改变,研究人员还可以将这些肿瘤分为64种类型。

此外,研究还注意到存在一些潜在的可干预的共改变,这意味着联合疗法可能有效。然而,他们补充说,由于缺乏安全数据、临床试验和慢摄取多组基因试验,联合治疗的发展一直充满挑战。

1.jpgHighlight

  •  33个瘤种的9125个标本的10个信号通路改变图谱

  •  包含驱动基因分类的可重复模板

  •  57%的肿瘤至少存在一个以上通路的一个潜在驱动基因

  •  可干预的基因变化共表达提示了联合治疗机会

TCGA PanCancerAtlas Pathways Dataset and Workflow 

之一:不同瘤种的基因改变分布,含分子亚型分析  

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之二: 治疗分析通路流程图

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十个通路及相互作用

不同频率的基因改变,致癌基因的激活(红)和抑癌基因的失活(蓝)及不同基因改变的类型(拷贝数改变、突变、融合或表观遗传沉默),及通路间相互作用。

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通路突变的频率

各个瘤种每个通路改变样本的分数和肿瘤亚型,颜色约亮突变数越高,在结直肠癌、胃癌和子宫内膜癌中,MSI和POLE型也被分组。

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九种信号通路中最常见的基因改变

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这篇文章将是我们对肿瘤认知,药物研发与临床治疗开启新的里程。 

这么一篇好文,你一定想去好好了解吧,文后福利:

下载地址:DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.03.033



评论
2018年04月07日
邹兰林
景德镇市第二人民医院 | 肿瘤科
确实又是一个Milestone。