首页 > 文章详情

2026 WCLC | 全外显子组测序鉴定336例间皮瘤患者队列中的富集胚系变异

08月28日

编译：肿瘤资讯

来源：肿瘤资讯

Session Type

Mini Oral

Session Title

MO04. Novel Therapeutics and Molecular Insights in Thymic Malignancies and Pleural Mesothelioma

摘要号

MO04.05

英文标题

Enriched Germline Variants in Patients With Mesothelioma Identified by Whole Exome Sequencing in a Cohort of 336 Individuals

中文标题

全外显子组测序鉴定336例间皮瘤患者队列中的富集胚系变异

讲者

Alexander Burdzy, BS

讲者机构

University of Chicago

引言

间皮瘤是一种罕见但侵袭性强的恶性肿瘤，主要由石棉暴露所致。近期研究在12%-16%的间皮瘤患者中发现了致病性胚系突变。既往研究依赖于靶向经典癌症相关基因的二代测序panel来鉴定致病性变异。在其他肿瘤类型中，全外显子组测序（WES）已被证明能检测到固定panel之外的其他变异，从而实现对多种生物学通路胚系变异的分类。然而，WES数据在间皮瘤中的临床可操作性仍未知。本研究采用WES，以鉴定传统癌症相关panel未涵盖基因中的富集致病性变异。

方法

我们对该领域迄今最大规模的间皮瘤患者队列（n=336）进行了WES，这些患者来自芝加哥大学。鉴定并归类了致病性或可能致病性（P/LP）胚系变异，按功能通路进行分类。通过将基因和变异频率与gnomAD v4.1数据库（N=730,947例外显子组）中的群体对照进行比较，验证富集性。等位基因频率根据Hardy-Weinberg原理转换为预期群体频率。主要终点为基因水平和变异水平上P/LP变异相对于群体频率的富集程度。统计分析包括多重假设二项检验，并采用错误发现率（FDR）校正。富集倍数计算为样本频率与群体频率之比，显著性定义为FDR校正后p<0.05。

结果

纳入的336例患者中，平均年龄为65.4±12.8岁。63%为男性（n=211），多数为胸膜间皮瘤（n=239，71%），多数为白种人非西班牙裔（n=309，92%）。携带癌症相关P/LP变异的患者较其他组更可能患有腹膜或双腔疾病（p=0.037）。共有25个基因和52个P/LP变异在群体对照中显著富集。归类为DNA修复/癌症相关的基因显示出显著富集（6.9倍），包括BAP1（FDR p=1.63×10⁻¹⁶）和DNMT3A（FDR p=5.59×10⁻¹¹）。在免疫和肺功能相关基因中也观察到富集，包括SERPINA1（Z或S等位基因携带者n=16，FDR p<0.05）、C7（n=5，FDR p=4.59×10⁻¹¹）和ABCA3（n=2，FDR p=2.02×10⁻⁵）。

结论

WES鉴定了癌症相关和非癌症通路中胚系变异的显著富集。重要的是，免疫和肺相关基因（包括SERPINA1、C7和ABCA3）中变异的富集，凸显了可能改变疾病进展风险的生物学相关通路，这些通路是传统癌症聚焦panel无法捕获的。扩大胚系WES的应用可能改善风险分层，并为患者及其家属的未来监测策略和基因检测指南提供信息。

08月28日

陈海峰

绍兴第二医院 | 肿瘤内科

感谢分享受益良多继续学习