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【遇见MET】METex14跳突有哪些检测方式?

2023年12月06日
整理:肿瘤资讯
来源:肿瘤资讯

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MET 14跳突常见的突变位点分布区域较广,且突变形式多样,给临床检测和判读带来巨大挑战。目前MET 14跳突的检测方法主要包括RT-qPCR、DNA和RNA二代测序等,不同检测方法各有其优缺点,必要时可相互验证或补充。

RT-qPCR是以RNA为检测对象,在MET第13和第15号外显子区域设计引物,检测是否有特异性的扩增产物。该方法检测MET 14跳突准确率高,但对于一些与MET 14跳突功能相似的、特殊且罕见的MET变异形式(如Y1003位点氨基酸改变或缺失)会导致漏检。对于检测结果在阳性阈值附近的患者,其结果解释需谨慎,应结合样本质量、肿瘤细胞含量以及检测质控情况综合分析,必要时可使用其他平台进行复测。

DNA二代测序首选肿瘤组织样本或细胞学样本进行检测,目前试剂盒主要基于扩增子法和杂交捕获法2种建库方法来富集MET 14跳突相关区域片段以进行基因序列检测。考虑到导致MET 14跳突的变异位点和形式多样性,不同建库方法的检测能力也有一定差别,推荐建库的靶向序列至少应覆盖全部MET 13内含子、MET 14外显子以及MET 14外显子下游50 bp的范围(MET 14内含子内)。二代测序生物信息分析的数据库应尽可能包含全面的MET 14跳突位点信息,并定期更新。对于检测到的疑似MET 14跳突,在生物信息分析预测的基础上,建议辅以RT-qPCR或RNA测序验证。当肿瘤组织样本和细胞学样本不可及时,可考虑液体活检样本进行DNA二代测序检测,但ctDNA在肿瘤患者体内含量较低,对检测方法灵敏度的要求较高,可能存在假阴性,需要引起注意。

RNA二代测序是在RNA水平上检测MET第13/15号外显子融合来判断是否发生MET 14跳突。该方法直接检测MET 14跳突,检测覆盖范围明确,生物信息分析简单。尤其当患者发生影响剪接的非典型内含子突变时,该方法有助于识别MET 14 跳突。但与RT-qPCR一样,对于一些罕见的MET变异形式可能会出现漏检。


参考文献

1.非小细胞肺癌MET临床检测中国专家共识.中华病理学杂志, 2022,51(11): 1094-1103.


审批码TAB0013416-39132,有效期至2024-11-26,资料过期,视同作废

责任编辑:CY 
排版编辑:Lillian



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