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【第29期】MET基因常用的检测方法有哪些?

2023年07月03日
编译:肿瘤资讯
来源:肿瘤资讯

MET基因常用的检测方法有哪些?

程颖
一级教授、国家临床重点专科学科带头人、博士研究生导师、博士后工作站导师

享受国务院特殊津贴,卫生部突出贡献中青年专家
吉林省癌症中心主任
吉林省肿瘤医院恶性肿瘤临床研究一体化诊疗中心主任
吉林省肺癌诊疗中心主任
中国临床肿瘤学会(CSCO) 副理事长
CSCO小细胞肺癌专业委员会主任委员
CSCO临床研究专家委员会候任主任委员
中国抗癌协会肺癌专业委员会候任主任委员
CSCO非小细胞肺癌专业委员会副主任委员
CSCO肿瘤大数据专家委员会副主任委员
中华医学会肿瘤学分会肺癌专委会副主任委员
中国医师协会肿瘤多学科诊疗专委会副主任委员
中国医师协会肺癌培训专业委员会副主任委员
国家卫生、计生委常见肿瘤规范化诊疗专家组成员
吉林省医师协会肿瘤医师分会主任委员
吉林省医学会肿瘤专业委员会主任委员

程颖教授:目前临床主要关注的MET异常包括MET 14跳突、MET基因扩增和MET蛋白过表达,用于MET检测的样本类型主要包括肿瘤组织样本、细胞学样本以及液体样本等,常见的分子病理检测方法主要包括免疫组织化学检测、 FISH检测、RT-qPCR、Sanger测序、二代测序技术等。不同的分子病理检测方法有各自的优缺点,同时也受到MET变异类型、样本类型、样本质量、肿瘤含量、实验室条件等影响。

对于MET 14外显子跳跃突变,目前临床上主要通过NGS和RT-PCR方法来检测。在组织学或细胞学样本不可及的情况下,也会通过NGS检测循环肿瘤DNA(ctDNA)也可作为补充。RT-qPCR以 RNA 为检测对象,准确率相对较高,但对于一些与MET 14跳突功能相似的、特殊且罕见的 MET 变异形式,比如约占总体阳性2%的 Y1003 位点氨基酸改变或缺失,会导致漏检。对于检测结果在阳性阈值附近的患者,对结果的解释需要谨慎对待,应该结合样本质量、肿瘤细胞含量以及检测质控情况综合分析。必要的时候也可以使用其他平台进行复检。NGS允许短时间内同时检测大量核苷酸,有着低成本、高准确度、高通量和快速检测的优点,已成为目前最常用的基因检测手段之一。NGS可用来检测MET外显子14跳跃突变的mRNA或DNA含量。

MET基因扩增的检测方法目前主要包括FISH和二代测序。其中,FISH是检测MET基因扩增的金标准,适用组织及细胞学样本,能够直接计算肿瘤细胞中MET及第7号染色体信号,可以区分多体与局部扩增;所需样本相对较少,但目前尚无统一的判读标准,共识推荐阳性阈值为MET GCN≥5或MET/CEP7≥2作为判读标准。DNA二代测序可使用组织及细胞学样本或液体活检样本,通量高,样本可及性高,但灵敏度较低,其成熟度仍然有待验证。 

MET蛋白过表达检测方法为免疫组化,利用抗原与抗体特异性结合的原理,通过化学反应使标记抗体的显色剂(包括荧光素、酶、金属离子、同位素等)显色来确定组织细胞内抗原(多肽和蛋白质),对其进行定位、定性及相对定量的方法。
赛沃替尼为MET突变患者带来怎



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评论
2023年08月11日
梁留峰
叶县人民医院 | 消化内科
常见的分子病理检测方法主要包括免疫组织化学检测、 FISH检测、RT-qPCR、Sanger测序、二代测序技术等
2023年07月04日
何小罗
新沂市人民医院 | 胃肠外科
基因检测是目前临床用药的金标准
2023年07月04日
雷昕奕
永州市中心医院 | 胃肠外科
肿瘤治疗又有最新进展。