首页 > 文章详情

【2023 ASCO】TP53、KRAS、KIT或MDM2 CNA突变的未经化疗的GCT患者具有更高的铂类化疗耐药相关基因表达

2023年05月28日

编译：肿瘤资讯

来源：肿瘤资讯

2023年，第59届美国临床肿瘤学会(ASCO)年会将于美国芝加哥当地时间6月2日至6日举行。作为肿瘤界首屈一指的交流盛会，ASCO年会汇聚全球专家学者，重磅前沿进展令人目不暇接。【肿瘤资讯】特别对一项晚期生殖细胞肿瘤铂类化疗耐药探索的最新研究结果进行报道。

摘要：5007

标题：The genomic and transcriptomic landscapes of chemotherapy naive vs post-chemotherapygerm cell tumors.

讲者：Aditya Bagrodia, MD | University of California San Diego Health

作者：Yun Sawa, Liwei Jia，Harris Benjamin Krause,Fred Millard，Alex Patrick Farrell,Andrew Elliott,John T.Lafin,Christina Jamieson，Emmanuel S.Antonarakis,Anishka D'souza,James F. Amatruda，Siamak Daneshmand,Rana R. McKay,Matthew James Oberley,Chadi Nabhan

研究背景

30%的晚期生殖细胞肿瘤(GCTs)患者发生顺铂耐药。即使采用有效的挽救性治疗方案，仍有50%患者面临癌症特异性死亡风险。此前，我们确定了与顺铂耐药相关的分子特征，包括TP53突变和MDM2扩增(Bagrodia, 2016)。在此，我们评估了未经化疗与化疗后GCT的基因组和转录组图，以揭示可能导致顺铂耐药的遗传因素。

研究方法

在Caris Life Sciences (Phoenix, AZ)用新型DNA(592基因或全外显子组)和RNA(全转录组)测序检测GCTs (N = 138)。计算致病性SNVs /indel和拷贝数扩增(CAN≥6拷贝)的流行率。根据活检部位确定原发部位(N = 65)和转移部位(N = 73)。专门的泌尿生殖系统病理学家盲审选定的H& E染色切片，并根据治疗相关的变化指定肿瘤为未经化疗(N = 66)或化疗后肿瘤(N = 17)。差异调控通路通过基因集富集分析(GSEA)进行评估。转录组特征预测免疫治疗的反应(T细胞炎症)和铂敏感性(PSS，高分提示铂敏感性增加)。采用Mann-Whitney U检验和x²检验，对多次比较的p值进行调整。

研究结果

原发性和转移性GCT在铂类耐药的假设驱动因素之间有微小差异:KIT (15% vs 1)， TP53 (10% vs 17)， KRAS (13% vs 9)突变和MDM2CNA (4% vs 3)突变，p＞0.05。当比较化疗后与未经化疗GCTs时，未观察到基因组格局的显著差异(p＞0.05)。未经化疗肿瘤被证明富含与KRAS信号和上皮-间质转化相关的基因集。此外，与化疗后的样本相比，倾向于T细胞炎症肿瘤的比例更高(32% vs 18, p = 0.36)。未经化疗患者的平均PSS略高于化疗后(CN: 0.07任意单位(AU)， N = 62 vs PC: -1.82, N =16, p = .52)。未经化疗肿瘤有TP53、KRAS或KIT突变或MDM2CNA突变的PSS (-4.16 AU, N= 18)低于无这些突变的肿瘤(2.17 AU, N= 38)， p = 0.05。最后，未经化疗肿瘤中MDM2 CNA (N=2， -16.26 AU)的PSS最低，其次是TP53突变(N=6， -2.04)、KIT突变(N=2， -1.77)和KRAS突变(N=9， -1.05)(除同时发生KRAS和TP53突变外，突变相互排斥)。

研究结论

本研究表明，TP53、KRAS、KIT或MDM2 CNA突变的未经化疗的GCT患者具有更高的铂类化疗耐药相关基因表达。这些发现有助于更好地理解GCT患者的分子特征，并可能为预后和治疗提供信息。

责任编辑：肿瘤资讯-CY
排版编辑：肿瘤资讯-CY