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【2021 ASCO抢先看】口头汇报：无祖先差异的多基因乳腺癌风险评估

2021年05月20日

编译：肿瘤资讯

来源：肿瘤资讯

除了BRCA等倍受关注的基因之外，乳腺癌发病风险也与诸多基因中存在的单核苷酸多态性密切相关，绝大多数乳腺癌风险评估体系使用多基因风险评分的方法解决这一问题，但在这一过程中，研究人员却忽视了不同族裔女性遗传结构差异对基因-疾病风险的影响。今年，美国纳什维尔乳腺中心研究团队的一项最新研究将于两周后线上举行的ASCO年会“预防，降低风险和遗传性癌症”专场的进行公布和口头报告。该报告介绍了其最新开发的，不受女性族裔影响的乳腺癌多基因风险评估方案，该方案的问世无疑为全球不同族裔女性，尤其是那些有乳腺癌家族史的带来了帮助。

ASCO插图.jpg

背景

乳腺癌（BC）发病风险受单核苷酸多态性(SNPs)影响较小，可汇总成多基因风险评分(polygenic risk scores,PRSs)。PRSs方法首先在欧洲裔人口中进行了验证。为了使PRSs适用于全球所有妇女，美国纳什维尔乳腺中心(Nashville Breast Center) Sierra Madre团队开发并验证了一种新型的，涵盖不同祖源遗传背景的PRSs方案“全球性PRSs” (gPRS)，该方法立足于受检者个体的祖源遗传组成。

方法

该方案的祖源特异性PRSs基于源自来自3个大洲不同人种后裔的队列研究结果，共涵盖149个SNP位点（93个乳腺癌相关的，56个祖源信息相关的），其中纳入31,126例非洲裔美国人自我报导遗传学癌症筛查队列研究结果开发其非裔PRS方案，使用Asia Breast Cancer Consortium的公开数据开发其东亚裔PRS方案，使用Breast Cancer Association Consortium与 24,259欧洲女性癌症遗传学检测结果开发其欧洲裔PRS方案。对于每个患者来说，祖先信息SNPs用于计算归类评分，将其归类于3个不同大陆的不同遗传学祖先。gPRS位定义为根据其祖源SNP中不同来源权重计算的特定祖源组成。研究人员后续在一项涵盖62707人的独立验证队列评估了gPRS的鉴别和校准效率，并与前期已完善的欧洲裔妇女86-SNP PRS进行了比较。使用个人，家族癌症史、年龄和族裔调整的逻辑回归分析针对SNPs所进行PRs与BC的关联。

结果

在后续验证队列和自我报告族裔的子队列中，gPRS（评分）均体现出与BC的密切相关性（表）。在不同族裔的自我报告人群中，95％（88/93）的BC SNP的风险等位基因频率≥1％。与上述已成熟的欧洲裔女性乳腺癌86-SNP PRS相比，gPRS在总体上和不同人类亚群中均显示出更好的辨别力，只有亚洲人群因样本量太小而无法进行更为准确的比较。目前，针对欧洲裔女性的86-SNP PRS已针对非西班牙裔白人女性进行了校准，但却忽视了非欧洲裔人群。该研究团队开发的gPRSs更适用于不同族裔人群。

结论

149-SNP gPRS已针对所有祖先的女性进行了验证和校准。结合临床和生物学风险因素，此方法可以为所有妇女提供更好的乳腺癌风险分层，无论其血统如何。

参考文献

Elisha Hughes, Placede Tiemeny, Shannon Gallagher et al. Ancestrally unbiased polygenic breast cancer (BC) risk assessment. 2021 ASCO, abs 10502.

责任编辑：Annie
排版编辑：Annie