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【2020ASH抢先看】单细胞RNA测序发现pAML患者完全缓解后的化疗耐药残留细胞

2020年11月07日

编译：肿瘤资讯

来源：肿瘤资讯

美国血液学年会（ASH）成立于1958年，是全球最大的血液疾病病因及治疗的专业协会，其使命在于促进血液病研究及诊治水平的提升。2020年12月2日~8日，第62届ASH首次以线上形式召开，会议汇集了世界各地的血液肿瘤专家，将公布多项重磅研究结果。来自中国科学院北京基因组研究所的王前飞教授团队，开展的儿童AML化疗后残留肿瘤细胞特征的研究入选了本次会议的口头报告，【肿瘤资讯】特此整理，与您共享ASH会议上的中国好声音。

题目：Identification of Chemo-Resistant Residual Cell Population in Pediatric AML of Complete Remission By Single Cell RNA Sequencing

摘要编号：31

汇报时间：2020年12月5日，周六：7:45 AM

研究目的：已有研究证实白血病干细胞（LSCs）的残留是儿童急性髓系白血病（pAML）化疗耐药的机制。研究对14例达到临床完全缓解（CR，n=11）和部分缓解（PR，n=3）标准的pAML使用单细胞RNA测序（scRNA-seq），以发现化疗后残留细胞的细胞异质性和癌症特征。

研究方法：在诊断时和第一周期化疗的第26天（D26）使用54个未分类的总骨髓（BM）和/或外周血（PB）有核细胞行10×基因组scRNA-seq。pAML细胞和正常对照进行同一UMAP聚类，使用无监督聚类来鉴别肿瘤群落和正常细胞。如果和诊断时至少80%的细胞类似，并具有体细胞突变和/或已知AML mRNA表达印记伴有染色体重排，则群落被定义为肿瘤。通过和正常造血细胞转录特征最接近的细胞对比，肿瘤细胞分为12种细胞类型中的一种（HSC/MPP，LMPP，GMP，MEP，E/B/M，CLP，经典型/非经典型单核细胞，cDC，pDC和前/不成熟中性粒细胞样细胞）。

研究结果：结果发现诊断时细胞群落具有异质性，有5~9种不同类型。化疗后D26大多数（9/11）患者具有1~6个肿瘤群落（每个群落中位52个细胞）。这些D26残留肿瘤细胞具有已知AML特征性突变，并和诊断时肿瘤细胞集落一致。D26时这些残留肿瘤细胞占总BM细胞的1.4%，而形态学检查和流式细胞分析发现平均4.0%和0.71%的肿瘤细胞。

为进一步评估残留肿瘤细胞的化疗耐药性，研究人员聚焦于3个鼠模型中发现的和化疗耐药相关的不同特征，包括LSC活性，活跃氧化磷酸化（OXPHOS）或白血病再生细胞（LRC）状态。在D26发现的所有的18个残留肿瘤群落中，33.3%（6/18）具有至少一个化疗耐药相关的表达特征。3名具有HSC/MPP或LMPP样群落的患者（1例PR，2例CR）具有显著的LSC和OXPHOS相关特征，另一名有cDC样群落的患者具有LRC特征。所有4名患者均具有PCR检测到的不良细胞基因或驱动突变的持续存在。

研究结论：研究表明诊断和缓解时pAML具有异质性细胞群落。在耐受化疗的残留肿瘤群落中，小部分（6/18）为HSC/MPP样、LMPP样和cDC样细胞，具有已知的化疗耐药表达特征。该发现第一次提供了化疗后CR的pAML患者细胞异质性特征的体内证据。

责任编辑：Nathan
排版编辑：Nathan

参考文献

https://ash.confex.com/ash/2020/webprogram/Paper141139.html