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2025 WCLC | 伴有肿瘤经气道扩散的肺癌:原发肿瘤转录组生物特征与气道肿瘤簇表达分析

08月14日
编译:肿瘤资讯
来源:2025 WCLC
Session Type

Mini Oral

Session Title

MA07. New Perspectives in Pathology Biomarkers

摘要号

MA07.05

英文标题

Lung Cancer With Spread of Tumor Through Air Spaces: Transcriptomic Biosignature of Primary Tumors and Expression Analysis Airway Tumor Clusters

中文标题

伴有肿瘤经气道扩散的肺癌:原发肿瘤转录组生物特征与气道肿瘤簇表达分析

讲者

Whitney Brandt, MD

讲者机构

Washington University St. Louis

背景

高达40%的肺癌切除标本存在肿瘤经气道扩散(STAS)现象,这一病理学表现与不良预后和复发率升高相关。然而,目前对伴有STAS(SP)与不伴STAS(SN)的原发肿瘤基因组/转录组差异,以及气道内肿瘤巢(TN)的表达特征知之甚少。

方法

为填补这一知识空白,我们比较:(a)SP与SN肿瘤的基因组差异;(b)二者的转录组差异;(c)配对SP肿瘤与TN的转录组差异。采用新鲜冷冻肿瘤组织提取DNA/RNA进行测序:SN与SP肿瘤全外显子测序(WES)深度分别为100X和50X(匹配正常肺组织);RNA测序采用SigmaPlex试剂盒,数据经R语言DESeq2包标准化处理。通过构建两个组织芯片(各含20个SP肿瘤核心与20个配对TN核心),切片经H&E染色后,在Visium 10X基因组学平台进行空间转录组分析。差异基因筛选标准为FDR校正P值<0.05且倍数变化>1。通路分析采用GSEA平台与MSigDB Hallmark通路分析。

结果

11例SP与21例SN肿瘤的对比分析显示:(A)WES发现两组间MOV10L1(36.4% vs 4.72%,P=0.04)和CACNA1A(36.4% vs 4.72%,P=0.04)存在显著差异,但KRAS、EGFR、ALK、TP53、RET等主要驱动基因突变频率无统计学差异。(B)RNA测序显示SP组19,040个蛋白编码基因中有154个差异表达,通路分析提示紫外线反应相关基因表达上调。(C)14例腺癌与2例鳞癌的空间转录组分析显示:TN与SP肿瘤间存在472/15,045(3.13%)差异表达基因(含MMP19、COL3A1、COL1A2、CDKN2A等,图1),其中TN中存在6条差异表达通路,包括E2F靶标、G2-M检查点、上皮-间质转化(EMT)和有丝分裂纺锤体形成。

结论

本初步研究揭示SP与SN肿瘤的特异性转录组差异。TN可能代表原发肿瘤中更具侵袭性的亚群,其EMT和DNA修复通路基因的上调表达可能促进其在气道中的存活。若经验证,RNA生物标志物或可术前预测SP肿瘤,针对STAS的潜在靶向治疗也可在该侵袭性肺癌亚群中进行评估。

责任编辑:肿瘤资讯-Bear
排版编辑:肿瘤资讯-Bear


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评论
08月15日
李海志
常州市中医院 | 乳腺外科
原发肿瘤与气道播散肿瘤可能存在差别。
08月15日
栗小玲
邯郸市第一医院 | 神经内科
好好学习天天向上
08月15日
万军鸽
叶县人民医院 | 血液肿瘤科
原发肿瘤转录组生物特征与气道肿瘤簇表达分析