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2025 ASCO|Merkel细胞癌与小细胞肺癌患者肿瘤的扰动单细胞RNA测序

05月30日
编译:肿瘤资讯
来源:肿瘤资讯

专场:Rapid Oral Abstract Session:Developmental Therapeutics—Immunotherapy

摘要号:2520

英文标题:Perturbational single-cell RNA sequencing of patient tumors in Merkel cell and small cell lung carcinomas.

中文标题:Merkel细胞癌与小细胞肺癌患者肿瘤的扰动单细胞RNA测序

第一作者:Curtis Perry,Yale School of Medicine, New Haven, CT

研究背景

尽管免疫检查点阻断疗法具有变革性意义,但许多癌症患者仍无法获得长期生存。具有先天免疫特征的T细胞能分泌炎性细胞因子/趋化因子,并传递可能成为理想肿瘤免疫的强效细胞毒性信号。新型双链RNA传感器RIG-I激动剂SLR14可改善小鼠黑色素瘤的控制效果。我们测试了SLR14能将免疫"冷"肿瘤标本中的T细胞转化为细胞毒性状态的假说。

研究方法

我们开发了名为PERCEPT的技术平台,通过扰动单细胞RNA测序直接检测患者肿瘤和免疫样本对新型及现有疗法的离体反应(见表)。获取9例原发或转移性黑色素瘤、Merkel细胞癌(MCC)及淋巴结转移灶手术标本,建立肿瘤与浸润免疫细胞共培养的悬浮复制体系。刺激42-48小时后(见附表),采用荧光激活细胞分选(FACS)获取活细胞,并使用10x Genomics单细胞RNA测序进行条形码标记。运用CINEMA-OT算法识别与治疗反应及耐药性相关的关键因子。构建并验证CRISPR-KO的MCC和小细胞肺癌(SCLC)细胞系,与CD14+单核细胞或单核细胞源性树突状细胞共培养。

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研究结果

RIG-I激动剂SLR14在肿瘤细胞、NK细胞和T细胞中诱导了超越经典IFN刺激基因的表达谱。在肿瘤-免疫共培养体系中,SLR14促使肿瘤浸润T细胞进入抗病毒状态,并启动T细胞体外产生IFNγ。但与黑色素瘤样本相比,MCC免疫浸润对IFN/SLR14的反应性显著降低。CINEMA-OT扰动性计算分析鉴定出细胞因子midkine(MDK)与MCC无应答相关。敲除MDK可恢复MCC和SCLC肿瘤细胞系对IFN及SLR14的反应性,共培养的CD14+单核细胞及单核细胞源性树突状细胞也呈现相同的恢复趋势。

研究结论

本研究表明多功能细胞因子midkine通过抑制肿瘤和免疫细胞对IFN及SLR14的先天免疫感知,在多个环节破坏肿瘤免疫循环。该效应在黑色素瘤中相对罕见,但在MCC和SCLC中表现显著。本研究通过直接评估患者肿瘤及免疫样本,揭示了神经内分泌肿瘤MCC和SCLC中富集的新型耐药机制。

责任编辑:肿瘤资讯-TY
排版编辑:肿瘤资讯-TY



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05月30日
田英娜
馆陶县人民医院 | 肿瘤内科
Merkel细胞癌与小细胞肺癌患者肿瘤的扰动单细胞RNA测序