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2024 WCLC 中国之声 | 时空基因组和转录组分析将指引非吸烟肺癌患者的治疗策略

08月16日
编译:肿瘤资讯
来源:2024 WCLC

2024世界肺癌大会(WCLC)将于美国当地时间9月7-10日在圣地亚哥举行,旨在为全球肺癌领域的学者、专家、从业人员提供最新临床研究、科学研究成果及广阔的学术交流平台。
近日,WCLC官网已披露部分摘要。其中多项由中国研究者主导的重要研究成果入选大会摘要,在国际盛会唱响中国好声音。北京大学人民医院发表了一项时空基因组和转录组分析揭示了非吸烟肺癌的分子景观和肿瘤内异质性的研究,【肿瘤资讯】特此整理,以飨读者。

摘要标题:Spatiotemporal Genomic and Transcriptomic Analysis Reveal Molecular Landscape and Intratumoral Heterogeneity in Non-Smoking Lung Cancer

时空基因组和转录组分析揭示了非吸烟肺癌的分子景观和肿瘤内异质性

摘要号:OA15.06

背景

肺癌是全球癌症死亡的主要原因,其发病在很大程度上可归因于吸烟。然而,不吸烟者中肺癌的发病率仍然是全球重大的健康问题。以往对肺癌多区域测序的研究大多集中在吸烟者身上,缺乏对非吸烟者肺癌分子图谱的全面分析。因此,了解内源性致突变因素和肿瘤内异质性(ITH)对于理解非吸烟肺癌的独特特征至关重要。

方法

我们对中国非吸烟人群(CXDY队列,n=127)的早期非小细胞肺癌(NSCLC)肿瘤与正常相邻组织进行了全面的基因组和转录组分析。与西方吸烟人群(TRACERx队列,n=421)相比,我们揭示了与肺癌早期事件和非吸烟相关过程相关的分子景观。

结果

我们对CXDY肺癌患者的全外显子组(127名患者,389个区域)和转录组(115名患者,304个区域)进行了测序,其特征是女性比例较高(54.5%)、亚包膜结节(45.5%)、腺癌(84.1%)和吸烟史比例较低(21.2%)。这些结果揭示了肺癌在东西方之间在流行病学和临床病理学特征上的显著差异。通过构建系统发生树和计算基因组ITH,我们发现中国NSCLC患者具有更稳定的基因组,表现为更高的SNV-ITH和更低的SCNA-ITH。这种差异在吸烟者中比非吸烟者更为明显。此外,中国人群中亚克隆WGD事件的发生可能性比克隆WGD事件更高。与非吸烟者相比,吸烟者的突变在NMA(p=0.037)和NDR通路(p=0.009)中显著富集。转录组ITH通过肿瘤内表达距离(I-TED)来表征,发现吸烟史和亚克隆突变(%)是影响I-TED的重要因素,而亚克隆SCNAs(%)在TRACERx队列中更为重要。区域内的转录组聚类产生了两个亚型,C1和C2。不吸烟、女性、I期和腺癌显著集中在C1亚型,该亚型显著涉及细胞稳态和生物学功能。相比之下,C2亚型在与DNA复制和细胞分裂相关的通路中富集,提示预后不良。使用四种常见的免疫浸润算法计算免疫-ITH,发现非吸烟者的免疫异质性显著较低。

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结论

本研究阐明了非吸烟肺癌的全面分子结构和多组学ITH,为肺癌治疗策略的发展提供了新的见解。


责任编辑:肿瘤资讯-Nydia
排版编辑:肿瘤资讯-Nydia


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