首页 > 文章详情

破译 pax5 基因的结构畸变及其与 B-ALL诊断分类和治疗结果的相关性

2023年10月15日

整理：肿瘤资讯

来源：肿瘤资讯

以促进血液学科技进步和共享最新研究成果为主旨，第28届欧洲血液学协会（EHA）年会于2023年6月8~11日以线下结合线上的形式召开。在本届大会上，北京陆道培血液病研究所分子医学研究中心，北京陆道培医院病理科及临床医学实验室的一项“破译 pax5 基因的结构畸变及其与 B-ALL诊断分类和治疗结果的相关性”最新研究成果入选大会Poster。【肿瘤资讯】特别整理，以供学习。

研究背景

PAX5 是 B 细胞分化所需的重要转录因子。众所周知，PAX5 的畸变会导致各种形式的 B 细胞淋巴细胞白血病（B-ALL）的发生。然而，由于 PAX5 结构变异的复杂性，全面的检查和分析仍具有挑战性。

研究目的

破译 PAX5 基因的结构畸变，研究其与 B-ALL 诊断分类和治疗结果的相关性。

研究方法

研究人员对21例新诊断或复发/难治性B-ALL患者的骨髓样本进行了光学基因组图谱（OGM）和外显子组测序（RNA-seq），以破译PAX5结构变异，包括融合基因的形式、外显子缺失和外显子重复。还分析了 B-ALL 中的其他病理融合基因和基因突变，并对患者的治疗结果进行了随访。

研究结果

在21例病例中，共有11例（52.4%）检测到PAX5结构变异，包括5例儿童（年龄<14岁）和6名成人（2.5~55岁，n=20），男女比例为4.5:1（9/2）。其中，5 例（45.4%）携带 PAX5 帧内融合基因，而伴侣基因 RNF38、BCL2 和 NSD1 尚未报道。4例（36.3%）由于 510Kb 9p 局灶缺失而携带 PAX5::ZCCHC7 融合转录本，这在功能上导致了 PAX5 的截断。另外 2 例（18.3%）携带 PAX5 局灶缺失（分别为外显子 6 和外显子 6-7）。11 例病例中有 8 例（72.7%）发生了 IKZF1 改变，其中以 IK10 最常见（4 例）。

11 例病例中有 8 例携带其他可定义 B-ALL 亚型的基因异常，包括 2 例 BCR::ABL1、3 例 BCR::ABL1-like（分别为 NUP214::ABL1、EBF1::PDGFRB 和 RCSD1::ABL2）、1 例 E2A::PBX1、1 例ETV6::RUNX1 和 1 例超二倍体。两例 CRLF2@ IGH 阳性，但没有定义 B-ALL 亚型的基因异常。

6例被评估为高危病例接受了嵌合抗原T细胞（CAR-T）治疗，其中5例接受了异基因造血干细胞移植（all0-HSCT），这5例病例直到最后一次随访（21~63m）前一直保持病情缓解。未接受异基因造血干细胞移植的患者在发病13个月后死于复发。（表1）

表1 pax5 基因不同的结构畸变与治疗结局【EHA2023】破译 pax5 基因的结构畸变及其与 B-ALL诊断分类和治疗结果的相关性1199.png

研究结论

PAX5 结构畸变是各种形式 B-ALL 中常见的重要遗传事件，包括框架内基因融合、3'缺失（PAX5::ZCCHC7）和局灶外显子缺失。OGM结合RNA-seq有助于破译病理PAX5结构异常。PAX5 结构异常大多发生在 BCR::ABL1 阳性和 BCR::ABL1 样性患者中，且常与 IK10 相关。CAR T 桥接异基因造血干细胞移植治疗有助于改善这些患者的预后和存活率。

参考文献

Tong Wang, Ming Liu，et al. DECIPHER STRUCTURAL ABERRATIONS OF THE PAX5 GENE AND THEIR CORRELATION WITHDIAGNOSTIC CLASSIFICATION AND TREATMENT OUTCOME IN B CELL LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA.
EHA2023, P346

责任编辑：肿瘤资讯-Jenny
排版编辑：肿瘤资讯-tong

2023年11月03日

刘林夏

江苏省肿瘤医院 | 药剂科

PAX5 的畸变会导致各种形式的 B 细胞淋巴细胞白血病（B-ALL）的发生

2023年11月03日

徐宝连

浙江中医药大学附属第二医院(浙江省新华医院) | 血液肿瘤科

CAR T 桥接异基因造血干细胞移植治疗有助于改善这些PAX5结构异常患者的预后和存活率。

2023年11月03日

杨雪

西安医学院附属宝鸡医院 | 放疗科

PAX5 结构畸变是各种形式 B-ALL 中常见的重要遗传事件，包括框架内基因融合、3'缺失（PAX5::ZCCHC7）和局灶外显子缺失