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【2023 ESMO】GARNET研究出炉：揭示了直肠NET独特的基因组和表观遗传学改变，可作为风险分层的预后标志物

2023年10月19日

编译：肿瘤资讯

来源：肿瘤资讯

2023年欧洲肿瘤内科学会（ESMO）年会将于当地时间2023年10月20日~24日在西班牙马德里召开。作为全球最具权威性的肿瘤学学术会议之一，ESMO年会将公布肿瘤领域最新研究进展。

【肿瘤资讯】第一时间整理神经内分泌肿瘤领域重磅研究摘要，以飨读者。今年ESMO会议上， GARNET研究出炉：揭示了直肠NET独特的基因组和表观遗传学改变，可作为风险分层的预后标志物。

摘要号：1183MO

标题：通过多组学分析确定预后不良的直肠神经内分泌肿瘤（NET）的分子特征：一项多中心回顾性队列研究（GARNET）

背景

大多数直肠神经内分泌瘤（NET）都是G1级惰性肿瘤，预后良好。但也有少数肿瘤会发生远处转移预后不良，而且其与分子特征的关系尚不清楚。本研究旨在确定直肠NET的基因组、转录组和表观遗传学改变。有助于更准确地预测直肠NET的预后。

方法

该研究是一项多中心、非介入性队列研究，进行了多组学分析，包括全外显子组测序（WES）、基于单核苷酸多态性（SNP）阵列的拷贝数、基因表达和甲基化分析。根据预后将患者分为3个队列（即队列A[无复发，自初次手术起存活≥5年]、队列B[自复发和/或转移起存活≥3年]、队列C[自复发和/或转移至死亡存活<3年]）。主要终点是揭示 B 组和 C 组直肠 NET 与 A 组相比的独特分子改变。

结果

共入组了 40 名直肠 NET 患者，并对 36 名患者进行了分析（14 名 G1-NETs 患者和 22 名 G2-NETs 患者；A 组 11 例、B 组19例和 C 组 6例）。WES 发现 CDC27 中有 17%（35 例中有 6 例）的复发性体细胞突变，这些突变仅在 B 组和 C 组中发现。很少涉及的癌症基因：仅有两例患者的 SF3B1 发生突变，其余基因包括 TP53、SMAD4 和 ATM 均有一例发生突变。拷贝数分析显示，56%（34 例中的 19 例）的为染色体19p13.3增益，29%（34 例中的 10 例）的为16p11.2染色体缺失，这种现象在更多的出现在B 组和 C 组。A 组和 B 组之间的基因集富集分析显示，在队列 B 中，氧化磷酸化和 MYC 靶基因组在上调基因中明显富集。DNA甲基化的无监督层次聚类分析显示了3个亚组，其中聚类1主要由队列A组成，聚类2由队列B和队列C组成。

结论

预后不良的直肠NET（队列B和队列C）具有独特的基因组和表观遗传学改变，可作为直肠NET风险分层的预后标志物。

参考文献

T. Shibuki.et al. Molecular characterization of rectal neuroendocrine tumors (NETs) with unfavorable prognosis by multiomics analysis: A multicenter retrospective cohort study (GARNET).2023 ESMO 1183O.

责任编辑：肿瘤资讯-Cynthia
排版编辑：肿瘤资讯-Astrid