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【遇见MET】MET扩增的检测方式和检测时机？

2023年12月07日

整理：肿瘤资讯

来源：肿瘤资讯

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MET基因扩增的检测方法目前主要包括FISH、二代测序等。

1.FISH：FISH技术通过荧光探针原位标记MET基因，可以结合形态直接观察肿瘤细胞中MET荧光信号的数量，来计算肿瘤细胞中MET基因GCN；或者通过标记MET基因和第7号染色体着丝粒（CEP7），计算肿瘤细胞中MET/CEP7比值。临床可以通过MET GCN以及MET/CEP7比值来判断扩增情况，该法可区分局部扩增和多体，目前是检测MET基因扩增的金标准。FISH检测MET基因扩增尚无统一的判读标准，目前主要参考UCCC（University of Colorado Cancer Center）标准和Cappuzzo标准。针对EGFR-TKI耐药后MET基因扩增相关的临床试验中，主要采用MET GCN≥5或MET/CEP7≥2作为入组标准，本共识推荐该入组标准作为判读参考阈值。当MET/CEP7≥2时，判断为局部扩增；当MET GCN≥5且MET/CEP7<2时，判断为多体。后续根据临床研究的结果，具有疗效预测价值的MET基因扩增阈值可能会有调整。

2.DNA二代测序：DNA二代测序方法可以基于测序深度和特定位点变异频率等信息对检测MET基因拷贝数变异进行计算，首选肿瘤组织样本或细胞学样本。不同公司或实验室使用的二代测序检测panel和生物信息分析策略可能有所不同，检测结果的呈现形式也可能不同。临床研究中目前多采用FISH方法入组MET基因扩增患者，已有报道组织二代测序（肿瘤细胞比例≥10%，测序深度≥500×）与FISH检测MET基因扩增的阳性一致性约为62.5%，TATTON研究中组织二代测序（肿瘤细胞比例≥20%，测序深度≥200×）与FISH检测MET基因扩增的阳性一致性为48%，进一步分析发现二代测序与FISH检测的MET局部扩增阳性一致性为88%，与FISH检测的MET多体阳性一致性仅为4%。二代测序检测MET基因扩增有待进一步优化和验证，因此建议临床选用经NMPA批准或经充分验证的二代测序产品对MET基因扩增进行检测。在EGFR-TKI耐药后进行检测时，由于穿刺活检获取组织样本存在挑战，血液样本也是重要的检测样本来源。TATTON研究中，与组织FISH检测相比，ctDNA二代测序检测MET基因扩增的阳性一致性为25%（局部扩增43%，多体10%）。因此，现阶段血液二代测序检测MET基因扩增仍存在挑战，需要进一步的优化验证，应优先采用组织样本进行检测。若受限于样本进行血液检测时，检测阴性不能排除MET基因扩增，必要时考虑二次活检FISH复测。

3.MET基因扩增新方法探索：微滴式数字PCR（droplet digital PCR，ddPCR）是对微滴体系进行扩增反应以后，分析每个微滴的荧光信号，将判断结果按照泊松分布的原理，通过读取靶标和内参核酸的阳性微滴个数以及比例从而得到靶分子的拷贝数及浓度，在MET基因扩增检测尤其血液检测领域已有相关探索。但该方法在临床应用前尚需进一步优化和验证。

参考文献

1.非小细胞肺癌MET临床检测中国专家共识.中华病理学杂志, 2022,51(11): 1094-1103.

审批码TAB0013416-39115，有效期至2024-11-26，资料过期，视同作废

责任编辑：CY
排版编辑：Lillian