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CD5阳性大B细胞淋巴瘤系列研究之二——基于靶向DNA测序和Lymph2Cx细胞起源测定的CD5+DLBCL分子分型研究

2022年09月22日
整理:肿瘤资讯


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桑威
医学博士,副教授,副主任医师,硕士生导师

徐医附院细胞研究和转化医学中心副主任

徐医附院血液科科副主任,淋巴瘤病区主任

中华医学会血液学分会淋巴细胞疾病学组委员

中国抗癌协会淋巴瘤专委会委员

中国EBV相关疾病工作组秘书长

中国抗癌协会血液肿瘤专业委员会青年委员 

中国抗癌协会血液肿瘤委员会慢淋工作组委员

中国抗癌协会第一届T细胞淋巴瘤工作组委员

中国老年医学会血液学分会淋巴瘤学组委员

江苏省淋巴瘤联盟副主席

江苏省医学会血液学分会淋巴瘤/骨髓瘤学组委员

江苏省“六大人才高峰”培养对象

江苏省“科教强卫工程”青年医学人才

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马东慎

徐州医科大学附属医院病理科,主管技师,博士
长三角地区临床病理质控联合体分子病理质控工作组委员
徐州市抗癌协会生物和转化治疗专业委员会常委

研究背景

弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)是一组常见的具有明显临床、病理和遗传特征异质性的B细胞淋巴瘤。CD5+DLBCL占所有DLBCL病例的5-10%,在临床上常具有更强的侵袭性和更差的预后。与CD5- DLBCL相比,CD5+D LBCL在老年患者中更常见,而且常常表现为结节外受累。更重要的是,CD5+DLBCL患者较难从基于利妥昔单抗的免疫化学疗法或干细胞移植中获益,用R-EPOCH(利妥昔单抗、依托泊苷、泼尼松、长春碱、环磷酰胺和多柔比星)治疗时,总生存期(OS)<30个月。因此,探索CD5+DLBCL的新治疗策略是当务之急。

近年来,基于基因组测序的研究提出可从基因变异的角度对DLBCL进行分子分型。Schmitz等人于2018年提出,DLBCL病例被细分为以下四类:MCD(基于MYD88 L265P和CD79B突变的共同出现),BN2(基于BCL6融合和NOTCH2突变),EZB(基于EZH2突变和BCL2易位),N1(基于NOTCH1突变),以及 "其他 "亚型(无特定遗传特征)。其中MCD和N1亚型的患者相比于BN2和EZB亚型的患者的预后较差。该研究加深了对DLBCL分子遗传学的理解,同时提供了在线工具LymphGen为该分型方案的实际使用提供了具体的实用工具。

除此之外,基于基因表达谱(GEP)的研究也揭示了DLBCL在细胞起源(COO)上的异质性。根据细胞起源不同DLBCL被分为ABC型、GCB型和未分类型,其中ABC型预后较差。最近,基于NanoString平台的Lymph2Cx法被用于在福尔马林固定石蜡包埋组织中检测COO相关mRNA表达,这极大促进了COO分类的临床应用。

研究目的

以往针对CD5+的研究中发现,若干临床病理变量被确定为CD5+DLBCL的独立预测因素,包括年龄、国际预后指数(IPI)和MYC表达。此外,对细胞起源的研究表明,CD5+DLBCL病例主要是ABC亚型。然而,对于CD5+ DLBCL的临床病例研究还停留在表型层面,缺乏对分子遗传学分型的研究。此外,尚未有研究基于Lymph2Cx法检测CD5+ DLBCL病例的COO。本文旨在阐明CD5+DLBCL的分子特征和COO分型,并挖掘潜在的预后因素。

研究方法

本研究纳入了24例CD5+DLBCL和23例CD5-病例并收集临床病理特征信息。我们对这些病例进行了靶向DNA NGS测序,测序Panel包括475个淋巴瘤相关基因,并使用LymphGen工具对所有病例的分子亚型进行分类。采用Lymph2Cx法检测15个COO相关基因的mRNA表达量并进行COO分型。采用Kaplan-Meier法和Cox比例危险模型来挖掘与CD5+ DLBCL可能相关的预后因素。

结果

在被检测的475个基因中,近一半的CD5+DLBCL患者发现PIM1、MYD88和CD79B变异。其他常见于CD5+DLBCL的变异基因是KMT2D、BTG2、ETV6、HIST1H1E、TBL1XR1等(图1A)。CD5-DLBCL患者通常可见DUSP2、BCL6、SOCS1和TBLXR1变异。其他常见于CD5-DLBCL的变异基因是BTG2、CD79B、EBF1、MYD88、BTG1等(图1B)。CD5+和CD5-DLBCL具有较为相似的变异类型占比(图1C,D),而CD5+病例的拷贝数变异明显多于CD5-病例(2.4% vs 0.5%,P = 0.0377)。大多数基因变异都在CD5+和CD5-DLBCL中均可发现,只有7个基因在两组之间有明显的不同(表1)。

表1. CD5+/CD5-DLBCL 的遗传变异和分子分型差异

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CD5+DLBCL更常见MYD88突变(62.5%,n = 15,P = 0.0189)、PIM1突变(66.7%,n = 16,P = 0. 0032)、KMT2D突变(41.7%,n = 10,P = 0.0173)和CDKN2A突变(23.8%,n = 5,P = 0.0496)。CD5-DLBCL更常见DUSP2突变(47.8%,n = 11,P = 0.0305)、TET2突变(17.4%,n = 4,P = 0.0496),以及BCL6重排(26.1%,n = 6,P = 0.048)。CD5+病例相比于CD5-病例有较高的药物敏感突变频率(图1E)。提示其可以从靶向治疗中获益,特别是基于PIM1激酶抑制剂、BTK抑制剂HDAC抑制剂的治疗。此外,与CD5-DLBCL相比,CD5+DLBCL显示出更高的染色体不稳定性(图2F),但肿瘤突变负荷没有任何明显的差异(图1G)。

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图1. 基于DNA的靶向测序揭示了CD5+ DLBCL和CD5-DLBCL之间的基因差异。CD5+ DLBCL(A)和CD5- DLBCL(C)中最常见的基因变异具有显著的区别。CD5+ DLBCL(B)和CD5- DLBCL(D)的变异类型具有相似性。(E) 在CD5+DLBCL中,抑制剂敏感性变异更为常见。(F, G) 与CD5-DLBCL相比,CD5+DLBCL具有更高的染色体不稳定性,但肿瘤突变负荷无显著差异

我们根据Schmitz等人提出的分类器对所有CD5+和CD5-DLBCL病例进行分子分型。结果显示,MCD亚型占CD5+DLBCL病例的一半以上,明显高于CD5-DLBCL(54.17% vs. 13.04%,P = 0.005),而BN2(26.09% vs 4.17%,P > 0.05)和其他亚型(60.87% vs 37.5%,P > 0.05)主要见于CD5-DLBCL病例,但无统计学差异。

基于Lymph2Cx的COO研究显示,ABC亚型占CD5+DLBCL的62.5%(15/24),但仅占CD5-DLBCL的34.78%(8/23)。GCB亚型仅占CD5+DLBCL的12.5%(3/24)但在CD5-DLBCL中为60.87%(14/23)。此外,25.0%(6/24)的CD5+DLBCL和4.35%(1/23)的CD5-DLBCL为未分类型。这些结果表明,相对于CD5-DLBCL,CD5+DLBCL更常见ABC亚型(P = 0.0017)(图2)。

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图2.基于Lymph2Cx法对(A)CD5+ DLBCL和(B)CD5- DLBCL的COO进行分类

我们分析了COO相关mRNA表达水平与DLBCL预后的关系。研究发现,Lymph2Cx法检测的15个COO相关mRNA中,有9个与DLBCL的预后相关。我们进一步分析这9个mRNA的表达水平在CD5阳性或阴性组中是否仍与预后相关,以确定这些mRNA是否是独立于CD5的预后相关因素。研究表明,CYB5R2的低表达提示了更好的总生存期(OS)和无进展生存期(PFS),达到了CD5+组中CYB5R2低表达组的水平(P < 0.05)(图3B),表明CYB5R2是预后不良的一个独立因素。此外,MME(CD5+/MME高表达组)和SERPINA9(CD5+/SERPINA9高表达组)的高表达也提示了较好的预后(P < 0.05) (图3D,E)。

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图3.COO相关mRNA表达水平与CD5+ DLBCL预后的相关性


最后,我们纳入了其它关键的临床病理学指标与mRNA表达共同进行多因素Cox分析,结果发现MYC/BCL2双表达(P = 0.040,HR = 4.951 [95% CI:1.078 - 22.741])和ABC亚型(P = 0.039,HR = 7.430 [95% CI: 1.102 - 50.908])是OS的独立预后不良因素。SERPINA9 mRNA高表达是OS的独立预后有利因素(P = 0.021,HR = 0.028 [95% CI: 0.001 – 0.583]),而MME mRNA高表达是OS(P = 0.002,HR = 0.038 [95% CI: 0.005 - 0.290])和PFS(P = 0.003,HR = 0.156 [95% CI: 0.045 - 0.538])的独立预后有利因素。

结论

CD5+DLBCL的基因特征是PIM1、MYD88和KMT2D突变,较常见MCD和ABC亚型。MYC/BCL2双重表达、ABC亚型、SERPINA9和MME的mRNA表达水平是CD5+DLBCL的独立预后因素。


作者:马东慎 桑威

单位:徐州医科大学附属医院血液科淋巴瘤中心

来源:Frontiers in oncology,2022



               
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评论
2022年09月22日
陈州华
湘潭市第二人民医院 | 肿瘤科
DLBCL是一组常见的具有明显临床、病理和遗传特征异质性的B细胞淋巴瘤
2022年09月22日
杨雪
西安医学院附属宝鸡医院 | 放疗科
MYC/BCL2双重表达、ABC亚型、SERPINA9和MME的mRNA表达水平是CD5+DLBCL的独立预后因素