首页 > 文章详情

【Annals of Oncology】液体活检能为胆管癌患者带来什么好处？

2022年12月27日

作者：肿瘤资讯

来源：肿瘤资讯

液体活检技术操作便捷、无创，可实时动态监测，cfDNA作为液体活检的主要分析物之一，在晚期胆管癌患者的诊疗格局中扮演着何等角色？【肿瘤资讯】与您一同探讨这一问题。

组织活检vs.液体活检

目前分子标志物检测的标本主要有两个来源：一是肿瘤组织标本，即“组织活检”，用于检测肿瘤的体细胞突变；二是外周血标本，即近些年提及较多的“液体活检（Liquid biopsy）”。液体活检分析物主要包括循环肿瘤细胞（CTC）、血浆内游离高度片段化DNA（cfDNA）、循环肿瘤DNA（ctDNA）等。

相较于传统组织活检耗时、标本不易获得、难以克服肿瘤异质性、操作具有侵入性等弊端，液体活检在很大程度上弥补了这些缺陷：操作便捷、无创、支持实时动态监测、着眼于全面的肿瘤突变格局。

本文则聚焦于cfDNA。cfDNA是指游离于血液中的细胞外DNA，主要来源于衰老、凋亡的血细胞和肿瘤细胞释放的片段化DNA，无论是胚系突变、还是肿瘤的体细胞突变都可能经过cfDNA技术检测出来¹。

胆管癌队列中cfDNA检测的临床实用性如何？

J.E.Berchuck等人近期于Annals of Oncology发表了一项研究²，这是迄今为止分析cfDNA在胆管癌（BTC）患者临床诊疗实用性的规模最大、最为全面的一次评估（图1.试验流程图）。

图1.试验流程图

cfDNA可检测出哪些突变基因？临床可操作的突变有哪些？

首先，研究入组了1671名晚期BTC患者，使用Guardant360 cfDNA NGS测定法采集血样并进行检测，总共针对2068个样本进行分析，该队列为cfDNA主要分析队列。

结果显示，在cfDNA主要队列中，晚期BTC患者中20个最常突变的基因为TP53、KRAS、PIK3CA、ERBB2、EGFR、EGFR2、IDH1、NF1、BRAF、STK11、APC、ARID1A、MYC、CCNE1、MET、AR、SMAD4、FGFR1、GNAS、NOTCH1（包括这些基因的非同义单核苷酸突变SNVs、插入与缺失indels、扩增amplifications、融合fusions突变）（图2.晚期胆管癌最常突变的20个基因）。

图2.晚期胆管癌最常突变的20个基因

根据OncoKB治疗证据等级（第二版），研究者将致癌或可能致癌的基因改变进行等级划分：1级、2级、3A级、3B级和4级，1-3B级定义为“临床可操作的突变”（图3.OncoKB治疗证据等级）。

图3.OncoKB治疗证据等级

结果显示，在该队列中，有44%的患者存在临床可操作的基因突变，包括IDH1突变、FGFR2融合、BRAF V600E突变、NTRK融合和RET融合（1级）；ERBB2扩增、FGFR2突变（3A级）；KRAS突变、PIK3CA突变、ATM突变/插入与缺失、NF1突变/插入与缺失、NRAS突变、FGFR1扩增、MET扩增、MET扩增、ERRB2突变、IDH2突变、BRCA2突变/插入与缺失、MAP2K1突变、BRCA1突变/插入与缺失（3B级）（图4.研究者评估的“临床可操作的基因”）。

图4.研究者评估的“临床可操作的基因

需强调的是，并非所有“临床可操作的突变”均具有靶向治疗的临床意义。

液体活检与组织活检结果是否具有一致性？

为检测液体活检与组织活检结果的相关性，研究者将cfDNA主要队列的cfDNA标本与来自AACR Project GENIE 数据库的349例晚期BTC患者、1152个肿瘤组织标本进行了对比。结果显示，两个独立队列之间cfDNA标本和肿瘤组织标本检测到的特定基因突变的发生率呈强正相关 (R²=0.96；P<0.001)（图5A）。

在临床可操作基因的突变频率方面，cfDNA标本和组织标本之间因不同基因突变类型而表现各异（图5B）。

在cfDNA标本和组织标本中观察到IDH1突变（P=0.92）、ERBB2扩增（P=0.66）、BRAF V600E突变（P=0.14）各自相似的突变频率；然而，FGFR2融合频率在组织标本中更高（cfDNA vs.组织：1.4%vs.4.3%；P=0.0018），FGFR2突变频率则在cfDNA样本中更高（cfDNA vs.组织：5.3% vs.2.0%；P=0.0077）。

BTC中两个最常见的突变基因TP53和KRAS在cfDNA标本和组织标本中的检测率相似（图5C）。

图5.液体活检与组织活检检测突变频率的相关性

cfDNA检测能否预测临床结局？

为方便后文的理解，在此引入“变异等位基因频率”的概念。变异等位基因频率（Variant Allele Frequency，VAF）可用于推断肿瘤的异质性和肿瘤纯度³。

不仅如此，在本研究中，研究者发现，经cfDNA检测的VAF高低可能会影响胆管癌患者预后。

研究者将105名未接受全身治疗的晚期BTC患者组成的队列定义为cfDNA临床结局队列，评估了最大VAF（定义：给定标本中任何改变的高峰VAF）的前四分位数与总生存期（OS）的相关性。

总体而言，该队列中患者的中位OS为16.0个月（95% CI 9.8-22.1个月）（图6A）。根据最大VAF的高低将患者分为四个分区（Q1-Q4）：Q1(0.0%-0.7%)、Q2 (0.8%-3.2%)、Q3(3.3% -9.0%)、Q4(9.1%-92%)。最大VAF的数值最高（Q4）的患者，OS最差(P=0.0498)。

基线时高VAF定义为最大VAF>9.0%；与之对应，基线时低VAF定义为最大VAF≤9.0%。

在接受过一线化疗的86例患者中，与低VAF患者相比，高VAF患者接受一线化疗中位OS、中位无进展生存期（PFS）均显著缩短，即OS方面：高VAF vs.低VAF为7.7个月vs.19.9个月；PFS方面：高VAF vs.低VAF为2.6个月vs. 7.6个月（图6D、6E)。

在接受靶向治疗的29例携带FGFR2融合或重排的胆管癌患者中，高VAF患者的中位OS及中位PFS同样均不及低VAF患者，即OS方面：高VAF vs.低VAF为 3.2个月vs.7.9个月；PFS方面：高VAF vs.低VAF为10.5个月 vs.15.3个月。

图6.基线VAF预测临床结局

结果表明：经cfDNA标本检测出的高VAF与晚期BTC患者较差预后具有相关性，因此cfDNA具有预测BTC患者临床结局的作用。

小结

相较于组织活检，以cfDNA为代表的液体活检在晚期胆管癌中可用于基因突变检测，并且除某些突变（如FGFR2融合）之外，检测结果与组织活检具有一致性。通过基线VAF的高低，cfDNA可预测接受化疗或靶向治疗的晚期胆管癌患者的生存获益。未来期待更多临床试验对于这一非侵入检查的深入探索。

参考文献

1.中国临床肿瘤学会(CSCO)结直肠癌专家委员会.结直肠癌分子标志物临床检测中国专家共识[J].中华胃肠外科杂志,2021,24(03):191-197.
2.Berchuck JE, Facchinetti F, DiToro DF, et al. The clinical landscape of cell-free DNA alterations in 1671 patients with advanced biliary tract cancer. Ann Oncol. 2022 Dec;33(12):1269-1283. doi: 10.1016/j.annonc.2022.09.150. Epub 2022 Sep 9. PMID: 36089135.
3.https://baijiahao.baidu.com/s?id=1689282229085566138&wfr=spider&for=pc

责任编辑：肿瘤资讯-Bree
排版编辑：肿瘤资讯-Bree