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癌症患者血中突变一多半来自白细胞!慎重解读血液基因检测结果

2019年12月25日
作者:申淑景
来源:肺癌多学科会诊

血液基因检测,也被称为:液体活检。有人认为液体活检能“准确”反映癌组织的突变情况,加上抽血简便易行,目前在临床上得以广泛应用。

甚至还有这样的说法:血浆如同混合的癌细胞DNA“汤汁”,所有癌细胞的DNA都会释放入血,所以检测血浆中游离的循环DNA突变,会比癌组织活检更全面。

但是,最近研究发现:这个“汤汁”中除了来自癌细胞的DNA,还混合有其它体细胞的DNA,癌症患者血检突变中,53.2%来自克隆性造血过程中的突变所致!

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克隆性造血(clonal hematopoiesis,CH)突变,是造血干细胞或其他早期血细胞祖细胞突变积累,有助于形成遗传上独特的血细胞亚群。血液中这种亚群的特征是细胞DNA共有一个独特的突变。随着年龄增加,这种突变率逐渐升高,老年人能达到31%

美国纪念斯隆凯特琳癌症中心的研究显示,肿瘤患者血液循环游离DNA (cfDNA,circulating cell-free DNA)中携带的大部分基因突变,可能不是来自于癌细胞,而是血液中的白细胞。这给液体活检相关的研究带来了挑战。

该研究获取了124 例癌症患者(肺癌、乳腺癌、前列腺癌)的cfDNA、肿瘤组织样本和白细胞DNA,以及47 名健康志愿者的cfDNA 和白细胞 DNA, 基于已获 FDA 批准的 MSK-IMPACT 平台给每个样本独立开展了高达60000× 的高度深度基因测序。

结果:

  1. 健康对照组中,血浆cfDNA突变中81.6%来自白细胞

  2. 非高度突变的癌症患者,血浆cfDNA突变中53.2%来自白细胞,

  3. 高度突变的癌症患者,血浆cfDNA突变中4.4%来自白细胞

  4. 健康对照者和癌症患者的血浆中,都有来源不明的突变,其中高度突变的癌症患者这种来源不明的突变率最高,这些来源不明的突变,可能是来源有:癌组织检测不到的突变、其它体细胞的突变等

  5. 来自克隆性造血的白细胞常见突变为:DNMT3A, TET2, PPM1D 和P53等


基于肿瘤组织的活检发现了740 个突变,基于cfDNA 的检测包含其中的530 个(71.6%)。在cfDNA 发现的基因突变中,有一些突变虽然在肿瘤组织检测中出现,但频率极低,还有一些在肿瘤组织和白细胞中均未出现过。提示cfDNA 检测和基于组织的活检还是存在一定差异的。
目前开展的血液基因检测,用的是DNA 低深度测序(一般在10000×),不能排除克隆性造血所致的假阳性结果,所以对于血液基因检测结果的解读要慎重!

该研究证实了cfDNA 检测相较于组织活检的优点,也提示在检测cfDNA 的同时, 一定要检测白细胞DNA,最好是超高深度测序。

评论
2020年04月03日
阙 丽 琳
玉林市第一人民医院 | 肿瘤内科
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2019年12月27日
邵丽娟
其他 | 销售部
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2019年12月26日
李泽华
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