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MPE上清液cfDNA检测指导晚期NSCLC靶向治疗新进展

08月25日

整理：肿瘤资讯

来源：肿瘤资讯

靶向治疗已成为晚期非小细胞肺癌（NSCLC）患者的标准一线治疗方案。然而，对于合并恶性胸腔积液（MPE）的患者，临床上常面临组织标本难以获取或肿瘤细胞含量过低等挑战，从而限制了分子检测的准确性。近年来，利用MPE上清液中的游离DNA（cfDNA）进行液体活检展现出巨大潜力，但肿瘤细胞密度对其检测性能的影响尚不明确，且在MPE标本（细胞块、上清液）与匹配血浆之间，最佳检测样本类型的选择仍存有争议。一项近期发表的研究旨在对比肺腺癌患者MPE上清液与配对细胞块的NGS分子检测结果，系统评估肿瘤细胞含量对两者检测性能的影响；同时对比MPE上清液与匹配血浆的分子图谱差异，并结合患者预后评估MPE上清液在指导靶向治疗中的临床应用价值。

入组患者的临床病理特征

本研究共纳入77例合并恶性胸腔积液的IV期NSCLC患者。患者年龄为34-86岁，其中男性37例，女性40例。在总体队列中，42例为初治患者，取样前未接受过靶向治疗，其中20例根据MPE上清液的分子检测结果制定了后续靶向治疗方案；55例患者既往有靶向治疗史。此外，分别有36例患者有配对的原发灶或其他转移灶组织学标本的NGS检测结果，25例患者有同期的血浆标本NGS检测结果。

MPE上清液质控及与细胞块突变检测的对比分析

所有77例患者样本的上清液（每毫升cfDNA中位产量83.8 ng，平均测序深度3914.8×）及细胞块标本（平均测序深度1901.9×）均成功完成DNA提取与测序。根据细胞块肿瘤细胞密度，标本分为G1、G2和G3三组。

在MPE上清液中，整体治疗相关突变检出率为68.8%（53/77），共鉴出88个突变，其中包括47个SNV/InDel；而细胞块中治疗相关突变的检出率为67.5%（52/77），共鉴出59个突变，其中包括43个SNV/InDel。

在MPE上清液中，继发/耐药组的突变检出率（71.4%，25/35）略高于初治组（66.7%，28/42）；而在细胞块中则相反，初治组的检出率略高于继发/耐药组初治组，分别为69.0% vs. 65.7%。两类标本中突变频率最高的基因均为EGFR，上清液46.8% vs 细胞块41.6%，主要改变包括19号外显子E746_A750del突变、21号外显子L858R突变和20号外显子T790M突变；其次为MET扩增，上清液9.1% vs 细胞块5.2%。

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图1 根据胸腔积液中不同的肿瘤细胞含量，将MPE上清液分为G1、G2和G3组

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图2 上清液和细胞块中靶向治疗相关突变的检测结果

MPE上清液与细胞块全类型突变检测图谱

在77份上清液标本中检测到320个癌症相关基因突变，检出率为97.4%（75/77），其中SNV/Indel突变243个，检出率为94.8%（73/77）。在细胞块标本中检测到186个癌症相关基因突变，检出率为89.6%（69/77），其中SNV/Indel突变146个，检出率为88.3%（68/77）。

研究者根据单核苷酸变异/插入缺失（SNV/Indel）、拷贝数变异（CNV）和结构变异（SV）对上清液和细胞块中的基因突变进行了分类与比较。SNV/Indel：上清液中突变频率最高的基因是EGFR（57.1%，44/77），其次是ERBB2（9.1%，7/77）、ALK和BRAF（均为6.5%，5/77）；而在细胞块中，突变频率最高的基因同样是EGFR（50.6%，39/77），其次是ALK和KRAS（均为3.9%，3/77）。CNV：上清液的检出率为46.8%（36/77），显著高于细胞块的15.6%（12/77），差异具有统计学意义（McNemar检验，p<0.001）。两种检测方法中检出率最高的CNV均为EGFR扩增（19.5% vs 6.5%）。

SV：上清液的检出率则略低于细胞块（10.4% vs 13.0%）。

MPE上清液与匹配血浆标本分子检测结果的比较

在25例匹配标本中，MPE上清液与血浆的突变检出率分别为96.0%（24/25）和64.0%（16/25）。血浆标本中共检测出9例（36.0%）EGFR突变（其中4例为L858R突变、3例为T790M突变），以及KRAS突变、FGFR3融合、ALK融合和ERBB2扩增各1例。

上清液的EGFR突变检出率（68.0%，17/25）显著高于血浆（36.0%，9/25；McNemar检验p=0.021，p>0.05），具有较好的一致性。如下图所示，三组不同肿瘤细胞密度上清液标本的EGFR检出率均高于血浆。此外，上清液比血浆多检出6例其他靶向相关突变，包括MET扩增4例，ERBB2扩增、RET融合及BRAF突变各1例；另有1例KRAS突变仅在血浆中检出。

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图3 上清液和血浆样本中EGFR突变的检测结果

结论

MPE上清液是NSCLC分子检测的高效样本来源，与细胞块相比，尤其是在低肿瘤细胞密度下，上清液展现出更优异的检测灵敏度，且在突变检测方面优于血浆。基于上清液的NGS检测结果可提供较可靠且具有临床指导意义的数据，从而能够助力无法进行组织活检的患者接受精准的靶向治疗。

参考文献

Wang Y, Liang S, Zhang JM, et al. Study on NGS-based molecular profiling of malignant pleural effusion supernatant cfDNA in guiding targeted therapy for non-small cell lung cancer. Lung Cancer. 2026 Jul;217:109463. doi: 10.1016/j.lungcan.2026.109463.

审批编号：CN-191547 有效期至：2027/8/12

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责任编辑：肿瘤资讯-Yuno
排版编辑：肿瘤资讯-wangr