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2026 WCLC | TROP2在NSCLC中的空间转录组学与蛋白质组学图谱揭示RNA-蛋白质不一致性及肿瘤微环境关联

08月20日
编译:肿瘤资讯
来源:肿瘤资讯
Session Type

Oral

Session Title

OA13. Resistance, Rewiring, and Reach: Lung Cancer Biology from Molecules to Metastasis

摘要号

OA13.02

英文标题

Spatial Transcriptomic and Proteomic Mapping of TROP2 in NSCLC Reveal RNA-protein Discordance and Tumor Microenvironment Associations

中文标题

TROP2在非小细胞肺癌中的空间转录组学与蛋白质组学图谱揭示RNA-蛋白质不一致性及肿瘤微环境关联

讲者

Jessy Deshane, PhD

讲者机构

University of Alabama at Birmingham

背景 

靶向TROP2的抗体药物偶联物(ADCs),包括datopotamab deruxtecan和sacituzumab govitecan,已获批或正在开发用于非小细胞肺癌(NSCLC)的治疗。临床试验尚未将免疫组织化学(IHC)检测的TROP2表达确定为疗效预测性生物标志物。目前缺乏对NSCLC中TROP2表达及其与肿瘤微环境(TME)关系的配对空间转录组学与蛋白质组学评估。

方法 

我们使用GeoMx数字空间分析技术,对NSCLC福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织切片进行检测,采用全转录组图谱(RNA)和免疫蛋白质组学图谱(蛋白)panel。区段按TissueID、感兴趣区域(ROI)和分区(CD8、肿瘤、间质)进行匹配。表达数据经Q3归一化并进行log2转换。我们评估了TROP2(TACSTD2)RNA-蛋白质相关性及分类一致性(高表达与中/低表达),并分析了肿瘤分区TROP2表达与去卷积细胞类型丰度及免疫检查点表达的相关性。所有分析在三个独立数据集中重复验证。 

结果 

我们获得了来自28个组织的152对匹配RNA-蛋白质区段(44个CD8、54个肿瘤、54个间质)。TROP2 RNA与TROP2蛋白呈负相关(Pearson r = -0.21,FDR < 0.05),总体TROP2分组一致性为61.1%。当样本基于RNA表达被分类为TROP2高表达时,100%的区段(26/26)蛋白为高表达;当被分类为TROP2中/低表达时,75%(21/28)的区段蛋白为高表达,表明存在不对称不一致性。肿瘤TROP2高表达区段与独特的检查点背景相关:在肿瘤腺癌区段中,与TIM-3(HAVCR2;r=0.28,FDR<0.01)和CD276(B7-H3;r=0.27,FDR<0.01)显著正相关,同时与PD-L1呈负相关(r=-0.34,FDR<0.001)。此外,在所有组织分区中,TROP2表达与中性粒细胞丰度正相关(r=0.32,FDR<0.05),与自然杀伤细胞和CD8 T细胞丰度负相关(r分别为-0.26和-0.21,FDR<0.05)。在TROP2高表达与TROP2中/低表达组比较中,CD8 T细胞丰度观察到0.86倍变化(TROP2高表达组平均丰度0.65 vs TROP2中/低表达组平均丰度0.76,FDR<0.05)。蛋白质组学跨分区分析发现,肿瘤TROP2蛋白表达在CD8(r=0.57,FDR<0.001)和间质(r=0.61,FDR<0.001)分区中均与CD47蛋白显著正相关,并在CD8(r=-0.56)和间质(r=-0.54)分区中与IRF3呈负相关。

结论 

据我们所知,本研究是首个在区段水平上对NSCLC中TROP2表达进行空间配对转录组和蛋白质组学图谱分析的研究。TROP2 RNA和蛋白经常不一致且呈分区依赖性,其中在CD8富集区段中观察到最强的负相关(r=-0.42)。TROP2高表达肿瘤区段具有独特的免疫检查点景观,与检查点抑制剂的联合治疗相关。这些发现支持分区特异性生物标志物解读及TROP2靶向ADC在NSCLC中的合理联合治疗策略。

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