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新鲜出炉!开发临床预测模型:分步指南(IF=93.6)

09月13日
来源:护理统计随笔

继《计算开发临床预测模型所需的样本量》、《临床预测模型的评估(第 1 部分):从开发到外部验证》《临床预测模型的评估(第 2 部分):如何进行外部验证研究》《临床预测模型评估(第 3 部分):计算外部验证研究所需的样本量》、《存在竞争风险的情况下预测模型的验证:现代方法指南》、《用于临床环境的临床预测模型展示指南》等系列预测模型教程之后,2024 年 9 月 3 日,The BMJ又发布了论文《Developing clinical prediction models: a step-by-step guide》,即:开发临床预测模型:分步指南。

此文由Efthimiou O, Seo M, Chalkou K等学者撰写,属于OA(开放获取),笔者是第一时间拜读了文献,发现这篇文献写的非常的详细,完全可以作为小白入门教程!

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这篇文献实在是写的太好、太详细了,以至于笔者都不知道如何去介绍了,似乎再怎么描述也不做到像原文写的那样精美,因此,强烈建议有兴趣的同学去精读原文。
虽然是英文版,但以大家的英语水平应该不在话下,再不济借助AI翻译或者一些传统翻译软件也是可以很好的理解原文意思的。所以,笔者不在此画蛇添足,仅简单为大家展示下此文的精华。

一、术语表(部分)

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二、临床预测模型的13个步骤

步骤 1:确定目标、组建团队、查阅文献、开始编写方案(ps:所有研究都需要)

步骤 2:选择开发新模型或更新现有模型(ps:研究目的)

步骤 3:定义结果衡量标准(ps:目标变量)

步骤 4:确定候选预测因子并指定测量方法(ps:确定自变量)

步骤 5:收集并检查数据(ps:注意缺失值、异常值,通常需要数据清洗)

步骤 6:考虑样本大小(ps:样本含量估计,所有研究都需要)

步骤 7:处理缺失数据(推荐使用多重插补,有两种合并策略)

步骤 8:拟合预测模型(ps:特色且重要!举一个需要注意的点)   

①注意偏差-方差权衡:

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②欠拟合与过拟合

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步骤 9:评估预测模型的性能(ps:特色点重要)

①区分度、校准度,不同类型结果预测模型应选择不同的性能测量指标。

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校准曲线

②内部验证、内部-外部验证、外部验证(作者呼吁外部验证研究应该与模型开发分开,最好是不同研究人员来做)   

步骤 10:确定最终模型

在性能接近的模型中选择更简单的模型(奥卡姆剃刀原理,一个著名的机器学习模型选择依据)

步骤 11:执行决策曲线分析

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DCA

步骤 12:评估各个预测因子的预测能力(可选步骤)

例如计算预测因子的重要性(重要性排序图,等等);对应于可解释性机器学习,如 SHAP(Shapley 加性解释)。

步骤 13:撰写并发布(遵守最新的相对应的报告清单)

三、流程图

作者画了一张精美的图,方便对上述步骤进行记忆:   

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此外,在文章的后半部分,作者们还给出了一个比较简单的案例解读,帮助读者更为深刻地理解预测模型的开发和验证。

参考文献

Efthimiou O, Seo M, Chalkou K, Debray T, Egger M, Salanti G. Developing clinical prediction models: a step-by-step guide. BMJ. 2024 Sep 3;386:e078276. doi: 10.1136/bmj-2023-078276.



排版编辑:肿瘤资讯-Lisa转载