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今日说精准 | 2021 ECP回顾：欧洲NGS应用现状调研及结直肠癌BRAF检测实践

2022年12月23日

来源：中国医学论坛报今日肿瘤

欧洲病理学会（ESP）成立于1964年，是欧洲病理学领域的领导者。作为学习型学会，ESP的主要目标是促进高质量的诊断实践、应用和转化研究以及在人类病理学领域的研究生教育。2021年第33届欧洲病理学大会（ECP）于2021年8月29日~31日在线上举行，来自全球相关领域的诸多专家分享、探讨了领域内诸多前沿进展。转移性结直肠癌（mCRC）是第三大癌症，近年来分子检测指导下的mCRC治疗发展较快，极大促进了疾病的临床治疗进程。此次ECP会议上，也有相关报道阐述了欧洲对mCRC基因检测的认知和应用现状，结果带来了诸多思考。

欧洲临床医生和病理医生对NGS的认知及使用情况调研

为进一步了解临床医生和病理医生对靶向二代测序（NGS）相关知识的掌握程度、态度和观点，研究人员进行了一项经继续医学教育（CME）认证的临床实践评估（含29个多项选择题，http://www.medscape.org/viewarticle/935597）。数据收集时间为2020年1月9日~2020年3月12日，共有超过200名欧洲临床和病理医生参与了调研，通过对检测方法、检测内容及结果分析等几个方面问题回答情况的统计，评估了欧洲临床医生和病理医生对NGS的了解和应用情况^[1]。

欧洲NGS的应用情况

临床中NGS的使用率结果显示，只有44%的临床医生和26%的病理医生会经常使用NGS方法进行检测，应用最多是免疫组织化学（IHC）的方法（临床85%，病理85%），其次是FISH方法（临床63%，病理47%），而PCR的使用率仍高于NGS（临床57%，病理40%）。在检测周期方面，有80%的临床医生和62%的病理医生反馈，NGS的报告周期需要10个工作日或更久。进一步了解临床实践中使用NGS的主要障碍，63%的临床医生和55%的病理医生表示，检测成本是最重要的因素，其次是缺乏设备、合格人员和报销等因素。

图1 欧洲NGS应用情况统计

对NGS的了解程度

那么临床医生和病理医生对NGS了解程度是怎样的呢？以NGS数据下机后的分析步骤为例，结果显示，64%的临床医生和74%的病理医生了解DNA/RNA测序结束后，需进行对比和突变鉴别的步骤。进一步结果显示，仅有20%的临床医生和病理医生适度或高度自信，能够向同事解释如何将NGS用于临床实践。该项说明欧洲医生对NGS认知仍有待提高，尤其是流程和应用方面。

欧洲NGS的临床实践

问卷又列举了具体案例以调查NGS的临床应用实践，例如在“患者女，61岁，患转移性肺腺癌，接受原发灶细针穿刺活检。根据现行ESMO指南，首选的生物标志物检测方法是什么？”问题中，只有52%的临床医生和41%的病理医生了解并根据EMSO指南进行分子检测（图2A）；只有19%的临床医生和31%的病理医生了解NGS方法可以发现新的融合伴侣（图2B）；44%的临床医生和33%的病理医生不了解NGS可以检测哪些类型的变异（图2C）；并且，只有28%的临床医生和病理医生了解肿瘤细胞含量是重要的质控，会影响检测结果（图2D）。

本次调研表明，欧洲临床医生和病理医生对NGS的了解程度还存在较大欠缺，同时NGS应用实践也存在诸多差异，这些都是临床中待解决的问题。

图2 欧洲NGS临床实践情况统计

从BEACON研究看BRAF突变检测实践

生物标志物（biomarker）在mCRC的治疗中具有重要的指导意义，也是目前研究的热点方向。BRAF突变阳性的mCRC患者预后不良，同时是mCRC患者接受encorafenib联合西妥昔单抗治疗的预测性标志物，因此2020版欧洲肿瘤内科学会(ESMO)指南推荐mCRC诊断时进行BRAF突变检测。本篇研究统计发现，在欧洲各地区BRAF检测率、检测时机、检测方法等方面存在一定差异，且BRAF突变检测率虽然有所增加，但仍低于RAS检测^[2,3]。（图3）

图3 欧洲国家mCRC患者的RAS、BRAF、MSI检测率

为进一步了解BRAF突变检测实践情况，本篇回顾性评估了BEACON CRC研究中510份样本BRAF突变的检测情况和2020年BRAF环形比对试验德国53个研究中心mCRC真实世界BRAF突变检测实践情况。

BEACON CRC研究为既往接受1种或2种治疗方案后疾病进展的BRAF V600E突变型mCRC患者的III期研究（图4），本次回顾的样本中有48.8%采用BRAF单基因检测、0.7%使用BRAF突变蛋白抗体进行IHC检测、50.5%的BRAF突变检测是与其他基因检测同时进行^[4]。研究中仅90.7%经中心实验室确认的样本在地方医院检测到BRAF V600E突变，可见地方医院和中心实验室在BRAF检测上存在一定的差异^[4]。

图4 BEACON CRC研究设计

BRAF环形比对试验中，评估了Sanger测序、焦磷酸测序、PCR、二代测序（NGS）、IHC等方法用于检测BRAF突变的一致性，该数据在本次大会报告中没有公布。

总结：

肿瘤精准诊疗时代下，分子检测在临床肿瘤诊疗中发挥越来越重要的作用，如何让分子检测技术更好助力于临床实践，推动其在肿瘤治疗决策方面的应用，成为相关临床工作者面临的挑战。

要让有力的“武器”发挥其最大作用，对其属性的充分了解十分必要。此次ECP大会的汇报表明，无论在临床试验还是实践中，分子检测的应用仍存在很多不足。要在临床实践中最好地运用以NGS为代表的分子检测技术，临床工作者还存在明显的知识缺口，只有通过各种形式的继续教育，不断加强相关人员对基因检测理念的认知，才能更好促进精准治疗的落地。（赞助公司：Merck 默克）

参考文献：

[1] Dorkhom N. ECP. 2021Poster: PS-15-004

[2] Hummel M. ECP. 2021Oral Free Paper: OFP-06-003

[3] Kopetz S, et al. J Clin Oncol 2021;39(Suppl):abstract 128.

[4] Hummel M, et al. Pathologe. 2021 Jul 14. doi: 10.1007/s00292-021-00946-5

责任编辑：肿瘤资讯-QTT
排版编辑：肿瘤资讯-HK

转自：中国医学论坛报今日肿瘤

2022年12月21日

张宇

盘锦市中心医院 | 肿瘤内科

肿瘤精准诊疗时代下，分子检测在临床肿瘤诊疗中发挥越来越重要的作用，如何让分子检测技术更好助于临床实践，推动其在肿瘤治疗决策方面的应用成为相关临床工作者面临的挑战。