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2024 AATS 中国之声 | 单细胞图谱揭示Treg多样性和BATF作为胸腺上皮肿瘤的预后标志物

05月09日
编译:肿瘤资讯
来源:肿瘤资讯

美国胸外科协会(AATS 2024)已于当地时间(EDT)2024年4月27日至30日在加拿大-多伦多圆满落幕。2024 AATS是全球胸外领域中负盛名的胸外科学术活动,提高专业知识,和行业内顶尖专家建立联系,并共同构建胸外科的未来。

在此,【肿瘤资讯】小编特别整理单细胞图谱揭示Treg多样性和BATF作为胸腺上皮肿瘤的预后标志物相关研究。

摘要号:P100

标题:Single-Cell Profiling Unveils Treg Diversity and BATF as a Prognostic Marker in Thymic Epithelial Tumors

讲者:Jianqi Zheng——广州医科大学附属第一医院

研究背景

胸腺上皮肿瘤(TET)是一种复杂且罕见的胸腺恶性肿瘤,需要深入探索其细胞组成,以推进诊断和预后见解。调节性T细胞(Tregs)在免疫调节中起着举足轻重的作用,而BATF是一种调节基因,有望作为预后标志物。本研究旨在揭示TET中的细胞多样性,特别关注Tregs及其与BATF的相关性,有助于加深对疾病的理解。

研究方法

本研究使用10x Genomics Cell Ranger工具包将文库读数与GRCh38参考基因组进行比对。使用Seurat进行无监督聚类、基因分析和差异基因鉴定。使用UMAP实现降维,并通过卡方检验评估组织分布。基因集分析利用fgsea软件包和来自msigdbr的参考基因集。为了分析基因对TET患者生存率的影响,本研究采用GEPIA2。

研究结果

本研究包括对30名TET患者的样本进行平行单细胞RNA测序分析,在质量控制后得出92个样本中321,074个细胞的转录组图谱。分析揭示了11种主要细胞类型,包括髓样细胞、DNT、DPT、DPT-循环细胞、B细胞、T细胞、浆细胞、肥大细胞、成纤维细胞、内皮细胞和上皮细胞。本研究特别关注T细胞,揭示了10个亚簇,特别突出Tregs的多样性。在C型TET中观察到明显的Tregs存在,其特征是激活且可能更具抑制性的表型。值得注意的是,BATF是一个关键的调控基因,通过调控FOXP3表达,在确保Treg稳定性方面发挥了重要作用。BATF表达升高与TET的不良预后相关,强调了其作为预后标志物的潜力。此外,BATF在各种重要器官中的表达量相对较低。这项研究为TET错综复杂的细胞组成提供了有价值的见解,并强调了BATF在Treg功能中的重要性,并具有潜在的临床意义。

研究结论

本研究显示,TET错综复杂的细胞景观,特别强调了Treg的多样性,特别是在C型TET中观察到的激活Treg。BATF是Tregs的关键调节因子和潜在的预后标志物,器官表达有限。

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参考文献

Jianqi Zheng, et al. Single-Cell Profiling Unveils Treg Diversity and BATF as a Prognostic Marker in Thymic Epithelial Tumors. 2024 AATS abstr P100.


责任编辑:肿瘤资讯-Bear
排版编辑:肿瘤资讯-Bear



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评论
05月09日
陈俊红
磁县肿瘤医院 | 肿瘤外科
学习学习学习学习学习学习
05月09日
李娜娜
上海蓝十字脑科医院 | 康复科
很实用
05月09日
黄丽琼
泉州德诚医院 | 肿瘤科
胸腺上皮肿瘤(TET)是一种复杂且罕见的胸腺恶性肿瘤,需要深入探索其细胞组成,以推进诊断和预后见解。