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npj Breast Cancer | 使用游离DNA预测转移性乳腺癌患者发生脑转移的风险

2023年05月06日

编译：肿瘤资讯

来源：肿瘤资讯

脑转移(BM)与转移性乳腺癌(MBC)较高的发病率和死亡率相关。了解影响脑转移发生的风险因素有助于对高危患者进行早期识别和治疗。

npj Breast Cancer 期刊于近期发表了一篇比较MBC确诊患者发生BM和未发生BM两种状态下的游离DNA (cfDNA)的研究，以了解BM的基因组预测因子，研究结果表明，在发生BM的患者中，BRCA2突变，APC突变，SMAD4突变和CDKN2A突变的患病率高于非BM的患者^[1]。

MBC在疾病表现、癌症亚型和分子特征方面与其它乳腺癌类型可能存在较大差异，这些不同的特征可能会影响患者的预后^[2-4]。已有研究发现，发生BM的MBC患者的发病率和死亡率显著升高^[5]。

由于难以通过外科手术获得脑组织，因此难以常规获得脑肿瘤组织进行基因分型。故而，发生BM的MBC患者的特异性基因组预测因子尚不清楚。

近年来，由于cfDNA可以检测出与治疗和预后相关的肿瘤突变,并且具有相比于肿瘤组织活检来说创伤性更低的优点，其已成为一种重要的检测策略。但目前尚不清楚cfDNA能否用于识别伴有BM高风险的MBC患者。

本研究旨在探索cfDNA用于识别具有发生BM高风险的MBC患者的潜在效用。

方法

本研究纳入了2016年1月至2019年10月期间在马萨诸塞总医院接受cfDNA检测，并进行了大于等于6个月的检测后随访的MBC患者。cfDNA是从全血中获得的，提取程序包括抽血、运输和血浆分离等。

通过在MBC确诊时收集的cfDNA，本研究比较了MBC确诊后发生BM 的患者和未发生BM(非BM )的患者的肿瘤基因分型结果，以了解基线基因组特征的潜在差异。

图1 研究队列的Consort流程图

结果

BM组与非BM组的临床特征

在MBC确诊时采集cfDNA的86例患者中，18例(21%)在病程中发生了BM，其中5例患者在MBC确诊时发生BM。cfDNA检测后发生BM的中位时间为11.5个月。发生BM后的中位生存期为11.6个月。 MBC确诊后发生BM的患者的中位总生存期为26.4个月，而非BM患者为54.6个月。

表1 BM患者与非BM患者的临床特征补充表1.png

BM组与非BM组的基因组特征

在发生BM的患者中，94% (17例)检测到至少1个cfDNA突变，而在非BM患者中，91% ( 62例)检测到至少1个cfDNA突变(P=0.65)。发生BM患者的基线cfDNA突变的中位数为4.5，非BM患者为3 (P= 0.31)。

突变模式在两组间存在差异（图2）。在发生BM的患者中，BRCA2突变（病例数：4/18 vs 3/68; 百分比：22.2% vs 4.4%; P=0.01），APC突变（病例数：2/18 vs 0/68; 百分比：11.1% vs 0.0%; P=0.005），SMAD4突变（病例数：2/18 vs 1/68; 百分比：11.1% vs 1.5%; P=0.05）和CDKN2A突变（病例数：2/18 vs 1/68; 百分比：11.1% vs 1.5%; P=0.05）的患病率高于非BM的患者。

图2 MBC患者在病程中发生BM与未发生BM的突变谱(基线cfDNA)

本研究还绘制了BM患者及非BM患者的突变谱，以评价BM（图3）与非BM（图4）患者的表达模式。

图3 个体BM患者的cfDNA突变谱

图4 个体非BM患者的cfDNA突变谱

本研究发现，18例BM患者中有7例在基线cfDNA中存在以下4种突变中的至少1种：APC、BRCA2、CDKN2A或SMAD4，而在68例非BM患者中，只有5例存在这4种突变中的至少1种（P=0.001）。此种基因组模式(含有以下4种突变中的至少1种: APC、BRCA2、CDKN2A或SMAD4) 在预测MBC患者早发性BM方面, 其阳性预测值为58%、阴性预测值为85%、灵敏度为39%、特异度为93%。

结论

本研究结果表明，在确诊MBC后发生早期BM的患者可能具有不同的基线cfDNA基因组学。本次研究使用cfDNA对基因组预测因子进行前瞻性分析，有助于指导精准医学干预，以降低发生脑转移的风险，还有助于开展筛查措施，以便更早地识别高危人群的脑转移。

参考文献

[1] Vidula N, Niemierko A, Hesler K, Ryan L, Moy B, Isakoff S, Ellisen L, Juric D, Bardia A. Utilizing cell-free DNA to predict risk of developing brain metastases in patients with metastatic breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2023 Apr 19;9(1):29. doi: 10.1038/s41523-023-00528-z. PMID: 37076495; PMCID: PMC10115848.
[2] Kennecke, H. et al. Metastatic behavior of breast cancer subtypes. J. Clin. Oncol.: Off. J. Am. Soc. Clin. Oncol. 28, 3271–3277 (2010).
[3] Xiao, W. et al. Breast cancer subtypes and the risk of distant metastasis at initial diagnosis: a population-based study. Cancer Manag. Res. 10, 5329–5338 (2018).
[4] Guo, Y. et al. Different breast cancer subtypes show different metastatic patterns: a study from a large public database. Asian Pac. J Cancer Prevent.: APJCP 21, 3587–3593 (2020).
[5] Taillibert, S. & Le Rhun, É. Epidemiology of brain metastases. Cancer Radiother. 19, 3–9 (2015).

责任编辑：肿瘤资讯-饶运双
排版编辑：肿瘤资讯-饶运双