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【2022 ASCO抢先看】罕见肿瘤：小肠腺癌的全面基因组和转录组特征

2022年05月29日

编译：SY

来源：肿瘤资讯

美国临床肿瘤学会（ASCO）年会是代表世界学术水平和权威性最高的全球顶级临床肿瘤会议。2022年ASCO年会将于6月3日~9日以线上会议的形式召开，目前ASCO官网已经公布了会议摘要。

小肠腺癌（SBA）是一种罕见肿瘤，一项研究在大型SBA患者队列中探索了全面基因组和转录组特征，为后续针对靶点的疗法提供了基础。

背景

SBA是一种罕见肿瘤，发病率逐渐升高，预后较其他肠道肿瘤更差。SBA的临床治疗主要引申自结直肠癌（CRC）的治疗方法。SBA全面基因组和转录组特征将有助于疾病特异性治疗策略的开发。研究探索了大型SBA患者队列的分子异常及其与临床结局的相关性。

方法

使用包括592个基因的二代测序（NGS）方法分析肿瘤组织DNA（592基因或全外显子测序[WES]），RNA（全转录组测序[WTS）和行免疫组化（IHC）分析。免疫浸润通过QuantiSeq计算。计算患者OS。

结果

共分析了823例SBA肿瘤：448例为原发灶，312例为转移灶；包括586例十二指肠（DA），95例空肠（JA），38例回肠（IA）。JA患者的中位年龄（57岁）低于DA（67岁）和IA（68岁）患者。

HER2过表达（2.5%）和扩增（3.6%）仅见于DA患者，而HER2突变更常见于JA（10%）患者，IA患者无HER2突变。IA具有最低的KRAS（30%）和APC（11%）突变率，最高的DDR突变（37%）。JA富集RSPO3融合（19%）和BRAF突变（21%）。在SBA的BRAF突变中，3类占53%，2类占37%，1类占10%。微卫星不稳定/错配修复缺陷（MSI/dMMR）见于8%的SBA患者，高肿瘤突变负荷（TMB-H）见于11%患者，各亚类中无差别。

和14000例CRC肿瘤相比，不论MSI状态，SBA具有显著更高的免疫浸润（p<0.001），最高改变见于髓样树突状细胞（15.5），Tregs（9.4），中性粒细胞（3.6）和M2巨噬细胞（3.5）。

研究SBA患者临床结局时（n=751），更好的预后标志物包括TMB38 mts/Mb（HR: 0.65, 95%CI: 0.50-0.85），APC突变（HR: 0.76, 95%CI: 0.62-0.93），MSH6突变（HR: 0.45, 95% CI: 0.20-0.99），HNF1A突变（HR: 0.268, 95% CI: 0.11-0.65），PRKDC突变（HR: 0.45, 95% CI: 0.20-1.01）和ERBB3突变（HR: 0.46, 95% CI: 0.26-0.82）。而TP53突变（HR: 1.32, 95% CI: 1.10-1.59），CDKN2A突变（HR: 1.7, 95% CI: 1.25-2.3）和PD-L1阳性（HR: 1.44, 95% CI: 1.09-1.90）可预测更差OS。

接受化疗的SBA患者中（n=258），DA较IA/JA具有更差OS（HR: 1.44, 95% CI: 1.05-1.98），OS劣于左半（HR: 1.86, 95% CI: 1.39-2.46）和右半（HR: 1.35, 95% CI: 1.01-1.79）CRC患者。DA患者OS显著劣于左半（HR=2.97, 95% CI: 1.73-5.08）和右半（HR=1.88, 95% CI: 1.08-3.24）CRC患者。

结论

这是目前规模最大的进行全面基因组和转录组特征分析的SBA队列研究。研究发现了亚类特异性靶点异常的富集，包括DA的HER2过表达/扩增，JA的BRAF/HER无突变和RSPO3融合，IA的DDR突变。SAB较CRC具有更高的免疫浸润，表明具有活跃的免疫调节。DA预后差，从化疗中获益低于左半和右半CRC。

参考文献

Karan Pandya, et al. Comprehensive genomic and transcriptomic characterization of small bowel adenocarcinoma. ASCO 2022 abstr 4018.

责任编辑：肿瘤资讯-B
排版编辑：肿瘤资讯-B