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非小细胞肺癌中多重RNA为基础的方法检测MET改变（上）

2021年01月25日

整理：肿瘤资讯

来源：肿瘤资讯

MET抑制剂在携带MET扩增或14外显子跳跃突变（MET△ex14）非小细胞肺癌（NSCLC）患者中具有活性，但是临床反应存在较大差异，对MET改变的分层和更准确的检测方法可能有助于改善MET抑制剂的疗效。近日，Mol Oncol上的一项研究在474名NSCLC患者中使用RNA为基础检测方法nCounter，联合二代测序（NGS）、荧光原位杂交（FISH）、免疫组化（IHC）和逆转录聚合酶链式反应（RT-PCR）检测MET改变，并探索其和临床获益的相关性，证实定量mRNA为基础的技术有助于改善MET异常的检出。

MET基因的异常活化是NSCLC的驱动靶点。NSCLC中MET扩增的发生率是1%~6%，MET 14外显子跳跃突变（MET△ex14）的发生率是3%~4%。临床上最常见的评估MET基因拷贝数改变的技术是FISH和NGS，而NGS和RT-PCR则是最常用的检测MET△ex14的方法，但是最佳检测方法和分层阈值尚未确定。多重RNA为基础的技术可能可用于MET检测，行研究对比nCounter和标准技术检测的结果。

研究方法

NanoString nCounter分析系统是一个高通量定量转录为基础的杂交技术，允许同时分析几百个靶点基因的检测。研究使用474例NSCLC患者的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）标本，对比nCounter和NGS、FISH、IHC和RT-PCR等标准检测技术的检测结果。

研究结果及解读

使用nCounter检测474例NSCLC FFPE样本，422例合格样本使用其他4种技术验证nCounter检测的MET状态。使用FISH和/或NGS检测拷贝数改变，RT-PCE或DNA为基础的NGS检测MET△ex14，IHC检测蛋白表达。检测结果概况如图1所示。

图1 nCounter检测结果概况。

使用nCounter在临床样本中检测MET△ex14 mRNA

MET△ex14/野生型MET呈双峰分布。422例样本中共发现了13例（3%）MET△ex14阳性患者，其中5名接受MET-TKI治疗并达到RECIST标准的部分缓解（PR，n=4）或稳定（n=1）。8/13名MET△ex14样本进行DNA为基础的NGS检测。5名（62.5%）发现了影响14外显子剪切位点的突变。2名患者同时具有PIK3CA突变，1名（20%）同时具有MET扩增（图2）。

图2 使用nCounter检测MET△ex14。（A）MET△ex14阳性的界值。（B）MET△ex14具有双峰分布。（C）nCounter检测MET△ex14阳性样本的热图及RT-PCR结果。

研究结论

研究验证了nCounter可以发现MET△ex14，提示MET mRNA表达非常高是扩增的替代，表明MET mRNA水平和MET-TKI反应的相关性。支持使用mRNA为基础的技术用于多重准确可信的MET改变评估。

参考文献

1. Aguado C, Teixido C, Román R, et al. Multiplex RNA-based detection of clinically relevant MET alterations in advanced non-small cell lung cancer. Mol Oncol. 2020 Nov 25.

仅供医疗专业人士参考

审批编号：CN-72081

有效期至：2021-4-19

责任编辑：肿瘤资讯-MJ
排版编辑：肿瘤资讯-Shelley