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2026 AACR | 双重甲基化荧光定量PCR检测法,助力卵巢癌早期精准诊断

05月07日
编译:肿瘤资讯
来源:AACR官网

2026年美国癌症研究协会(AACR)年会于4月17日至22日在美国加利福尼亚州圣地亚哥盛大召开。在当地时间4月20日的壁报展示环节中,Deepa Bisht教授团队带来的关于上皮性卵巢癌(EOC)液体活检的研究成果(摘要号:LB117)备受瞩目。
既往已有研究发现,上皮性卵巢癌中常出现抑癌基因RUNX3ZNF154的异常甲基化。基于此,Deepa Bisht教授研究团队开发了一种双重甲基化荧光定量PCR检测方法——即同时检测RUNX3ZNF154的甲基化水平,并在组织样本与血清样本中对该检测体系进行测试。该检测法在游离DNA(cfDNA)样本中在两种基因中均展现出良好的敏感度和特异度。【肿瘤资讯】特将内容整理如下,供广大同道参考交流。

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卵巢癌早筛困难,甲基化标志物成新方向

卵巢癌因其早期症状不典型且多在晚期确诊,导致患者的诊断和预后普遍较差。寻找有效的早期诊断标志物是改善患者生存的关键。

GpG岛是基因组中一段连续的DNA序列区域。CpG岛异常高甲基化可通过沉默抑癌基因发挥作用,是肿瘤发生的早期关键分子特征,同时也是可在多种体液中检测的理想肿瘤标志物。既往研究表明,肿瘤抑制基因RUNX3ZNF154在卵巢癌中频繁出现异常甲基化,有成为cfDNA中生物标志物的潜力。

双重甲基化检测如何设计?内参基因如何校正?

该研究旨在评估RUNX3ZNF154在EOC中的高甲基化水平及其诊断价值。

首先,研究团队通过靶向二代测序/亚硫酸氢盐扩增子测序(NGS/BSAS),确认了这些高甲基化CpG富集区在EOC中确实存在异常甲基化。基于初步数据,团队开发了一种双重甲基化荧光定量PCR检测法。

研究纳入100例组织样本(肿瘤70例、对照30例)及70例配对血清样本(肿瘤50例、对照20例),以COL2A1为内参基因,在组织与血清cfDNA中对该检测体系进行验证并评估其诊断效能。COL2A1是一个在正常细胞中稳定表达、甲基化状态恒定的基因。它的信号强度代表了样本中可检测的DNA总量,相当于给检测“定标”。通过计算目标基因(即RUNX3/ZNF154)的甲基化信号与COL2A1信号的比值(PMR)来消除样本质量、PCR扩增效率等技术因素的干扰,确保不同样本、不同批次的检测结果可以横向比较,提升诊断的准确性和重复性。

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单基因与联合检测:血清样本数据表现如何?

在组织样本中,ZNF154的灵敏度为89%、特异度为90%,RUNX3灵敏度为87%、特异度为83%;
在血清游离DNA样本中,RUNX3的灵敏度为84%、特异度为90%,ZNF154灵敏度为90%、特异度为92%。

该联合检测组合只需任一基因出现高甲基化即可判为阳性,其诊断效能优于单个标志物。在血清样本中,该组合对早期上皮性卵巢癌的检测灵敏度为92%、特异度为94%,曲线下面积(AUC)达0.95,且检测结果与患者临床病理特征具有明显相关性(p<0.05)。

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研究小结与未来临床应用展望

该项基于双重甲基化荧光定量PCR的前瞻性初步研究显示,该方法在cfDNA水平检测上皮性卵巢癌时具备优异的诊断效能,有望成为一种微创筛查工具。后续仍需开展多中心验证研究以推动其临床转化应用。

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评论
05月10日
徐宝连
浙江中医药大学附属第二医院(浙江省新华医院) | 血液肿瘤科
双重甲基化荧光定量PCR检测法,助力卵巢癌早期精准诊断
05月10日
赵艳秋
沈丘县人民医院 | 肿瘤内科
双重甲基化荧光定量PCR检测方法——即同时检测RUNX3与ZNF154的甲基化水平为卵巢癌的早期诊断增加了手段 1小时前
05月10日
夏月琴
盐城市第七人民医院(盐城市公共卫生临床中心、盐城市职业病防治院) | 肿瘤内科
双重甲基化荧光定量PCR检测方法——即同时检测RUNX3与ZNF154的甲基化水平为卵巢癌的早期诊断增加了手段