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NGS和FISH用于EGFR-TKI耐药后NSCLC的MET扩增检测

11月07日

整理：肿瘤资讯

来源：肿瘤资讯

引言：MET扩增是EGFR突变（EGFRm）NSCLC对EGFR-TKI常见的获得性耐药之一。MET扩增检测的方法主要包括荧光原位杂交（FISH）和二代测序（NGS），前者通常被认为是MET扩增检测金标准，后者耗时更短且检测通量更大。有必要对比NGS和FISH用于EGFR-TKI耐药后NSCLC MET扩增检测的优劣势。为此，来自华西医学院的研究者团队在116例NSCLC对EGFR-TKI耐药的患者标本中对比了NGS和FISH检测结果，相关成果已于2024年ELCC大会上报道，本文对此进行简要解读和分享，希望能为医务工作者提供新的科研和临床参考，造福更多肺癌患者。

研究背景

MET扩增是EGFRm晚期非小细胞肺癌（NSCLC）患者对EGFR-TKI的主要获得性耐药机制之一。已有国外研究者对比了基于不同标本检测MET扩增的可行性，支持优先使用组织标本进行MET扩增检测。

另一方面，MET扩增检测的方法主要包括NGS和FISH。NGS通常更高效，且可同时检测多个驱动基因靶点；FISH是MET扩增检测的金标准，但耗时更长，且技术门槛较高。有必要对比NGS和FISH用于EGFR-TKI耐药后NSCLC的MET扩增检测的优劣势。然而，在中国患者中，使用NGS和FISH检测MET扩增的数据有限。

研究方法

本研究纳入第一代、第二代或第三代EGFR-TKI治疗后进展的晚期NSCLC患者。通过NGS和FISH对组织活检样本进行MET扩增检测。同时，研究者还收集了配对的患者血浆样本，用于通过NGS进行MET扩增检测。基于检测结果，研究者分析了NGS和FISH检测之间的敏感性、特异性和一致性。

结果

对116例EGFR-TKI耐药后患者进行了分析，其中男性45例（38.8%）。34例（29.3%）患者在第一代或第二代EGFR-TKI进展后获取组织标本，80例（69.0%）患者在第三代EGFR-TKI进展后获取组织标本（表1）。

表1、入组患者的基线特征

FISH检测到43例患者（37.1%）存在MET扩增，其中19例（16.4%）为多发性扩增，24例（20.7%）为局灶性扩增。第三代EGFR-TKI和第一/二代EGFR-TKI耐药患者MET扩增的检出率分别为45.0%（36/80）和20.6%（7/34）。以FISH结果为参考，NGS检测组织中MET扩增的总体敏感性、特异性和一致性分别为39.5%（17/43）、98.6%（72/73）和76.7%（89/116）。对于局灶性MET扩增患者，NGS检测组织中MET扩增的敏感性、特异性和一致性分别为66.7%（16/24）、98.6%（72/73）和90.7%（88/97），NGS检测血浆中MET扩增的敏感性、特异性和一致性分别为29.2%（7/24）、94.5%（69/73）和78.4%（76/97）（图2）。

图2、不同TKI治疗组基于FISH的MET扩增检出率和NGS表现结果。NGS_CN_P指的是血浆样本中优化阳性阈值前的NGS表现结果。T代表组织。NGS_GCN_P指的是在优化阳性阈值后的NGS表现结果。

结论

虽然使用NGS对血浆样本进行MET扩增检测的敏感性需要进一步提高，但NGS是组织中MET局灶性扩增检测的一种可行方法。

参考文献

本文主要参考Qian Zheng, et al. NGS and FISH for MET amplification detection in post EGFR-TKI resistant non-small cell lung cancer (NSCLC) patients: A prospective, multi-center study in China. 2024 ELCC Abstract #21P; Annals of Oncology (2024) 9 (suppl_3): 1-53. 10.1016/esmoop/esmoop102569。

声明：本材料由阿斯利康提供，仅供医疗卫生专业人士参考

审批编号：CN-141961

过期日期：2024-11-29

责任编辑：肿瘤资讯-Bear
排版编辑：肿瘤资讯-Rex