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Nature | 2023例结直肠癌的基因图谱

09月13日
编译:肿瘤资讯
来源:肿瘤资讯

CRC是全球第三大常见恶性肿瘤。CRC测序项目仅限于几百例病例和/或基于全外显子组或基因组测序。尚未完全确定完整的基因组病变及其与临床特征的关联。一项发表在Nature上题为“The genomic landscape of 2023 colorectal cancers”的文章对2023个CRC样本进行全基因组测序,从而提供这种癌症的高度详细的体细胞突变图谱,影响因子为50.5。【肿瘤资讯】整理如下,以觞读者。


作者对来自英国十万人基因组计划参与者的2023个CRC样本进行全基因组测序,从而提供这种癌症的高度详细的体细胞突变图谱。综合分析确定了250多个假定的CRC驱动基因,其中许多以前并未与CRC或其他癌症有关,包括编码基因组之外的几种复发性变化。


作者扩展了参与CRC发展过程的分子通路,根据基因组特征定义了四种新的微卫星稳定CRC常见亚组,并表明这些亚组具有独立的预后关联。


作者还描述了几种罕见的分子CRC亚组,其中一些具有潜在的临床意义,包括同时具有微卫星不稳定性和染色体不稳定性的癌症


作者展示了整个结直肠的一系列突变谱,这些突变谱反映了病因差异。其中包括大肠杆菌colipks+在直肠癌中的作用以及SBS93特征的重要性,这表明饮食或吸烟是一个风险因素。


免疫逃逸驱动突变在超突变肿瘤中几乎无处不在,发生在大约一半的微卫星稳定CRC中,通常以HLA拷贝数变化的形式出现。许多驱动突变都是可操作的,包括与罕见亚组相关的突变(例如BRCA1和IDH1),强调了全基因组测序在优化患者护理中的作用。


参考文献

Cornish A, Gruber AJ, Kinnersley B, et al. The genomic landscape of 2,023 colorectal cancers. Nature.2024;633:127-136.


责任编辑:肿瘤资讯-Lisa
排版编辑:肿瘤资讯-Lisa

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