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寻根溯源丨ETV6::CHIC2融合基因AML:这些诊断“陷阱”,你遇到过吗?

07月25日
整理:肿瘤资讯
来源:肿瘤资讯

2024年7月22日,Hematology报道了一则罕见的急性髓系白血病(AML)伴ETV6::CHIC2融合基因和嗜碱性粒细胞增多的病例。通过形态学筛查、精确免疫分型、荧光原位杂交(FISH)分析和RNA转录组测序等方法,最终确诊为AML伴ETV6::CHIC2融合基因,而非FIP1L1::PDGFRA融合基因。与常见的AMLAML亚型不同,该患者的骨髓中出现了大量的嗜碱性粒细胞,这为诊断带来了挑战[1]。今天就与大家分享探讨,一起避开ETV6::CHIC2融合基因AML诊断“陷阱”。

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病例介绍:拨开AML诊疗迷雾,罕见融合基因发挥关键作用

患者,女,48岁,因“急性髓系白血病(AML)”于2023年4月就诊。
 
患者于2023年4月出现白细胞增多(白细胞计数46.95 × 109/L)、贫血(红细胞2.55 × 1012/L,血红蛋白73g/L)和血小板增多(血小板690 × 109/L)。患者同时伴有发热(体温最高38.0°C)和偶发性咳嗽。入院后实验室检查显示乳酸脱氢酶(LDH)469.1U/L(参考范围:120~250U/L),α-羟基丁酸脱氢酶(HBDH)385U/L(参考范围:72~182U/L)和C反应蛋白(CRP)24.71mg/L(参考范围:0~3.0mg/L)。

骨髓检查:骨髓象显示增生活跃,髓系与红系比例为10.86:1,原始细胞比例为35.5%,并可见较高比例的嗜碱性粒细胞(4%)和中性粒细胞(33.5%)。骨髓中的原始细胞形态中等,呈圆形或类圆形,染色质呈块状且相对致密,核仁单个或不明显,与“淋巴样”外观相似。同时,部分粒细胞胞浆颗粒减少,核分化异常(图1A)。外周血涂片显示白细胞增多,包括嗜碱性粒细胞(24%)和中性粒细胞(21%)(图1B)。
 
免疫表型分析:流式细胞术显示,异常细胞主要表达CD33、CD13、CD123、CD9和CD38,部分表达CD7、CD117、CD34、CD11b、CD11c、CD200、HLA-DR和CD25,髓过氧化物酶阴性。值得注意的是,部分细胞侧向散射光增强(gateR5:蓝色区域)(图1C),并表达CD34、CD7、HLA-DR、CD123、CD117、CD33和CD200。
 
细胞遗传学分析:染色体显带技术显示核型为46,XY,t(4;12)(q12;p13)(图1D)。ETV6/RUNX1双色易位探针显示中期细胞中存在ETV6基因重排(图1E)。

FISH检测:采用FIP1L1/CHIC2/PDGFRA探针进行FISH检测,结果显示94%的细胞中存在1个红/绿融合信号和1个绿色信号(正常信号模式为2个绿色信号),提示4q12位点存在断裂点,初步估计为FIP1L1::PDGFRA基因重排,但信号模式难以确认(图1E)。  

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图1:本例患者的病理检查结果。图中包括骨髓和外周血的细胞形态学分析(A、B),免疫表型分析(C),核型分析(D)以及基因重排分析(E)。结果显示患者存在髓母细胞(假淋巴细胞)增多,嗜碱性粒细胞增多,染色体易位t(4;12)(q12;p13),并伴随ETV6基因重排和4q12断裂。 

基因检测:30种AML相关融合基因检测均为阴性,而全转录组测序发现ETV6::CHIC2融合基因,变异水平为II级。二代测序(NGS)检测发现ASXL1、TET2和ZRSR2基因突变。根据欧洲白血病网络(ELN)专家组建议,存在ASXL1、EZH2、RUNX1、SF3B1、SRSF2、STAG2、U2AF1和/或ZRSR2基因突变的病例应归类为伴有骨髓增生异常相关基因突变的AML。这些突变预后不良。

综上所述,基于该患者的临床表现、骨髓象、免疫表型、细胞遗传学和基因检测结果,该患者最终确诊为“AML伴ETV6::CHIC2融合基因”。确诊后,该患者接受了维奈克拉和地西他滨联合治疗方案,并取得了良好的疗效:骨髓形态学达到完全缓解,原始细胞比例降至1.5%。

寻根溯源:下一代NGS深度测序,全基因组检测实现精准诊断与分型

t(4;12)(q11-12;p13)是一种罕见的染色体易位,常与AML相关。该易位导致ETV6基因与4q12区域的基因(如CHIC2、FIP1L1和PDGFRA)发生融合。
 
临床表现方面,t(4;12)(q11-12;p13)AML患者常伴有嗜碱性粒细胞增多,这与其他类型的AML(如伴有PDGFR重排的AML)不同,后者通常表现为嗜酸性粒细胞增多。
 
准确诊断t(4;12)(q11-12;p13)AML至关重要,后续可指导治疗决策的制定。传统的细胞遗传学技术(如染色体核型分析)可以识别t(4;12)易位,但无法确定涉及的具体基因。FISH技术可以检测常见的融合基因,如ETV6::PDGFRA,但对于罕见的融合基因,如ETV6::CHIC2,则可能出现假阳性或无法明确诊断。
 
为了克服这些限制,二代测序技术(NGS)已成为诊断t(4;12)(q11-12;p13)AML的有效工具。NGS可以精确定位断点并识别融合基因的伙伴基因,即使是罕见的融合基因。在临床上,如果怀疑患者患有t(4;12)(q11-12;p13)AML,建议进行NGS检测以明确诊断。准确诊断融合基因对于指导靶向治疗和化疗方案的选择至关重要。

小结:抽丝剥茧,精准破局:推动AML个体化治疗的发展

本文报道了一则罕见的伴有ETV6::CHIC2融合基因的AML病例,强调了罕见基因融合在AML诊断和治疗中的重要性,并强调了NGS在AML精准诊疗中的应用价值。
 
AML是一组异质性强的血液系统恶性肿瘤,其特征是骨髓中异常髓系母细胞的增殖和积累,抑制了正常造血功能。细胞遗传学和分子生物学异常,如基因突变和融合基因,是AML发病机制中的关键因素,并对疾病的诊断、预后分层和治疗决策制定至关重要。
 
ETV6::CHIC2融合基因是一种罕见的AML相关基因异常,由4号染色体和12号染色体易位导致。该融合基因的存在通常提示AML患者预后不良,需要积极采取治疗干预措施。然而,由于其罕见性以及与其他4q12区域基因融合的相似性,ETV6::CHIC2融合基因容易被常规细胞遗传学和FISH检测方法漏诊或误诊。
 
相比之下,NGS技术能够对基因组进行更全面和深入的分析,可以准确识别包括罕见融合基因在内的多种基因异常,为AML的精准诊断和分型提供更可靠的依据。
 
总之,该病例提示,对于疑似伴有t(4;12)(q11-12;p13)易位的AML患者,尤其是缺乏典型分子标志物或FISH检测结果不明确的患者,应积极考虑NGS检测以明确诊断,并指导后续的个体化治疗方案制定。

考一考你

在诊断伴有t(4;12)(q11-12;p13)易位的AML时,以下哪种检测方法最能准确识别ETV6::CHIC2融合基因?


A.染色体核型分析
B.FISH检测
C.RT-PCR
D.二代测序(NGS)

上一期《寻根溯源 | 伪装成HIV相关性淋巴瘤的小细胞肺癌:跨学科合作在复杂肿瘤诊疗中尤为重要》的答案为E 

参考文献

[1]        MA L, YUE Y, ZHANG X, et al. Acute myeloid leukemia with ETV6::CHIC2 fusion gene: 'Pitfalls' in diagnosis [J]. Hematology, 2024, 29(1): 2381170.


责任编辑:Ashelin
排版编辑:Ashelin
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