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采用综合杂交捕获平台检测单中心NSCLC患者分子谱的可行性探索

2023年12月28日

整理：肿瘤资讯

来源：肿瘤资讯

目前第二代测序（NGS）技术进行驱动基因检测已被用于非小细胞肺癌（NSCLC）。近日，一项发表在ESMO Open杂志上的研究，采用TruSight Oncology 500（TSO500）平台在连续200例NSCLC患者中评估了NGS平台检测的可行性。

研究简介

分子检测已经成为NSCLC患者管理的重要策略，但鉴于肿瘤组织少，需要检测的基因数目较多，现阶段临床上进行全面分子检测仍然具有挑战。NGS平台可以在短时间内同时检测多个分子变异，节约患者的组织标本和时间成本，且检测费用也逐步降低在可承受范围内。现阶段NGS已成为临床上检测NSCLC中可驱动基因突变的优选手段。

TSO500杂交捕获NGS检测平台覆盖523个基因的编码DNA区和55个基因的RNA转录区，可以检测碱基替换和小的基因插入或缺失改变、拷贝数变异、移接变异和基因融合，可精准检测微卫星不稳定（MSI）和肿瘤突变负荷（TMB）。本研究在连续200例NSCLC患者中评估了TSO500检测可靶向基因变异的成功率和突变谱，并评估患者接受靶向治疗后的预后。

主要结果

研究入组了2020年7月至2022年3月期间的非鳞癌患者，这些患者采用常规检测手段（PCR检测EGFR突变、IHC或FISH检测ALK/ROS1）未检测到EGFR活化突变、ALK和ROS1融合。

入组患者临床特征
连续200例患者采用TSO500 NGS平台进行检测，入组患者的中位年龄为64岁，大多数患者为男性（69.5%），目前或既往吸烟者分别占46.0%和40.5%，最常见的组织学类型为肺腺癌（81.0%），大多数患者诊断时为IV期（63.5%）。进行测序的组织或细胞学样本来源广泛：102例为活检标本（51.3%）、44例为细胞学标本（22.1%）、53例为外科标本（26.6%）。

采用TSO500 NGS平台检测可靶向驱动基因变异和其他有意义的基因变异
研究者在53例患者（26.5%）中检测到ESMO指南推荐的可靶向驱动变异，包括EGFR、ALK、ROS1、BRAF、KRAS、MET、RET、NTRK和ERBB2（图1A）。其中最常见的KRAS突变发生率为27.5%（55例），G12C突变率为9.5%（19例）。在9例（4.5%）患者中检测到EGFR常见突变。11例（5.5%）患者中检测到可靶向基因融合，包括ALK融合3例（1.5%）、RET融合5例（2.5%）、ROS1融合2例（1.0%）和NTRK1融合1例（0.5%），所有变异均互相排斥。

在10例（5.0%）肿瘤患者中测到7个可致病或潜在致病的基因变异，分别为MUTYH （n=4, 2.0%）、BRCA2（n=2，1.0%）、PALB2（n=1, 0.5%）、BAP1（n=1, 0.5%）、SDHA（n=1, 0.5%），还有1例（0.5%）患者同时检测到BRIP1和FLCN基因变异。

图1 采用TSO500 NGS平台检测到可靶向驱动变异

对比TSO500 NGS平台检测和单基因检测
131例（65.5%）患者在进行NGS检测之前进行了单基因检测，其中130例（65.0%）患者采用RT-PCR进行EGFR突变检测，分别有126例（63.0%）和103例（51.5%）患者采用IHC或FISH进行ALK或ROS1融合检测。其中4例患者NGS检测和单基因检测结果不一致。

接受靶向治疗对NSCLC患者生存的影响
研究分析了这一队列中接受靶向治疗患者的临床疗效，包括53例采用TSO500平台检测携带可靶向变异，2例低频突变（经过单基因检测验证，分别为ALK融合和MET exon14跳跃突变）和6例携带潜在可驱动变异的患者（MET融合和扩增、ERBB2扩增和FGFR1融合）。

在这一队列中，合并EGFR突变和RET或NTRK1重排的患者对比KRAS-G12C突变，BRAF-V600E突变、MET和ERBB2变异患者，接受靶向治疗的几率更高。35例（55.6%）患者虽然携带可治疗的靶向变异，但并未接受靶向治疗，主要原因为临床症状恶化。

所有患者的中位总生存期（OS）为20.7个月（95%CI：15-58.6个月），携带可靶向变异并接受靶向治疗的患者对比未携带驱动变异的患者，具有更长的中位OS，分别为尚未达到 vs 27.7个月（HR= 0.32; 95% CI 0.14-0.75；见下图2）。携带可靶向变异但并未接受靶向治疗的患者对比未携带驱动变异的患者，中位OS更短，分别为10个月 vs 27.7个月（HR=1.71; 95% CI：0.93-3.19）。

图2 有/无驱动突变及是/否接受靶向治疗患者的生存曲线

总结

这一研究显示，TSO500杂交捕获NGS检测平台在临床实践中可用于NSCLC患者驱动基因的检测，花费时间合理，失败率低。此外，检测驱动变异及接受靶向治疗对患者的生存有较大影响。因此，临床上需要为NSCLC患者进行NGS检测，并给予相应的靶向治疗。

参考文献

Molecular profiling and feasibility using a comprehensive hybrid capture panel on a consecutive series of non-small-cell lung cancer patients from a single centre. ESMO Open 2023, volume 8, Issue 6.

CN-127240
过期日：2024-3-25
*本文由阿斯利康提供支持，仅供医疗专业人士参考

责任编辑：肿瘤资讯-Yuno
排版编辑：肿瘤资讯-邓文普

2023年12月28日

刘敏

郑州大学第一附属医院 | 肿瘤内科

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2023年12月28日

吴枫阳

湖北省肿瘤医院 | 消化内科

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