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【2023 WCGIC】多标签转录分类反映结直肠癌肿瘤细胞异质性

2023年07月10日
编译:肿瘤资讯
来源:肿瘤资讯

2023年欧洲内科肿瘤学会(ESMO)世界胃肠道肿瘤大会(WCGIC)已于当地时间2023年6月28日~7月1日盛大举行。作为消化道肿瘤领域的全球顶级学术会议,WCGIC汇集消化道肿瘤的最新进展。本次会议上公布的一项研究中,研究者开发多标签转录分类,发现同一结直肠癌(CRC)标本可分属于不同分子类型,能够更好反映肿瘤异质性。


摘要号:SO-34
题目:结直肠癌多标签转录分类反映肿瘤细胞群异质性
讲者:意大利都灵大学,Candiolo癌症机构Enzo Medico教授

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摘要正文

背景:既往研究将CRC进行转录分类,可将其分为具有不同生物学和临床特征的分子亚型。但是还不清楚这种亚型代表了不同且互斥的类别还是潜在重叠的分子/表型状态。因此,本研究聚焦于CRC固有亚型(CRIS)分类,旨在探究将多种CRIS亚型分配至同一标本是否可提供额外临床和生物学相关信息。

方法:研究者开发了CRIS分类多标签版本(multiCRIS)以提供统计学框架,将相同CRC标本分配至五个CRIS亚型中的一个。随后,研究者将multiCRIS应用于606例CRC患者来源移植模型(PDXs),利用人CRC肿瘤和单细胞RNA测序数据集生成RNA测序特征;对比单标签和多标签CRIS生物学和临床相关性;开发机器学习为基础的多标签CRIS预测(ML2CRIS)用于单样本分类。

结果:约半数CRC病例可被multiCRIS显著分配至超过一种亚型。单细胞RNA测序分析显示多重CRIS可能是由于同时存在不同CRIS分类细胞,或存在具有杂合表现的细胞,但是后一种情况较为少见。多标签分配可改善CRC预后和治疗反应的预测表现。ML2CRIS分类在单样本分类中进行验证,显示其保留相同生物学和临床相关性。


结论:相同CRC标本可显著分配至多种CRIS亚型,反映了瘤内异质性。值得注意的是,当同时分配至同一标本时,CRIS亚型依旧保留生物学和临床相关性。这一方法或可扩展至其他肿瘤类型和分类系统。

参考文献

Medico E, et al. Multi-label transcriptional classification of colorectal cancer reflects tumour cell population heterogeneity. 2023 WCGIC abstr SO-34.



责任编辑:肿瘤资讯-Bree
排版编辑:肿瘤资讯-李莹洁



 

               
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